Protein–RNA interactions for Protein: Q52KE7

Ccnl1, Cyclin-L1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnl1Q52KE7 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccnl1Q52KE7 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccnl1Q52KE7 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccnl1Q52KE7 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccnl1Q52KE7 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccnl1Q52KE7 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccnl1Q52KE7 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccnl1Q52KE7 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccnl1Q52KE7 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccnl1Q52KE7 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccnl1Q52KE7 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccnl1Q52KE7 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccnl1Q52KE7 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccnl1Q52KE7 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccnl1Q52KE7 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccnl1Q52KE7 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccnl1Q52KE7 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccnl1Q52KE7 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccnl1Q52KE7 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccnl1Q52KE7 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccnl1Q52KE7 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccnl1Q52KE7 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccnl1Q52KE7 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccnl1Q52KE7 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccnl1Q52KE7 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccnl1Q52KE7 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccnl1Q52KE7 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccnl1Q52KE7 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccnl1Q52KE7 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccnl1Q52KE7 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccnl1Q52KE7 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccnl1Q52KE7 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccnl1Q52KE7 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccnl1Q52KE7 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccnl1Q52KE7 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccnl1Q52KE7 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccnl1Q52KE7 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccnl1Q52KE7 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccnl1Q52KE7 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccnl1Q52KE7 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccnl1Q52KE7 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccnl1Q52KE7 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccnl1Q52KE7 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccnl1Q52KE7 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccnl1Q52KE7 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccnl1Q52KE7 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccnl1Q52KE7 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccnl1Q52KE7 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccnl1Q52KE7 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccnl1Q52KE7 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccnl1Q52KE7 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccnl1Q52KE7 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccnl1Q52KE7 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccnl1Q52KE7 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccnl1Q52KE7 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccnl1Q52KE7 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccnl1Q52KE7 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccnl1Q52KE7 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccnl1Q52KE7 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccnl1Q52KE7 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccnl1Q52KE7 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccnl1Q52KE7 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccnl1Q52KE7 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccnl1Q52KE7 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccnl1Q52KE7 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccnl1Q52KE7 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccnl1Q52KE7 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccnl1Q52KE7 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccnl1Q52KE7 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccnl1Q52KE7 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccnl1Q52KE7 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccnl1Q52KE7 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccnl1Q52KE7 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccnl1Q52KE7 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccnl1Q52KE7 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccnl1Q52KE7 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccnl1Q52KE7 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccnl1Q52KE7 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccnl1Q52KE7 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccnl1Q52KE7 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccnl1Q52KE7 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccnl1Q52KE7 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccnl1Q52KE7 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccnl1Q52KE7 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccnl1Q52KE7 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccnl1Q52KE7 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccnl1Q52KE7 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccnl1Q52KE7 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccnl1Q52KE7 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccnl1Q52KE7 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccnl1Q52KE7 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccnl1Q52KE7 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccnl1Q52KE7 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccnl1Q52KE7 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccnl1Q52KE7 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccnl1Q52KE7 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccnl1Q52KE7 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccnl1Q52KE7 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccnl1Q52KE7 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccnl1Q52KE7 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms