Protein–RNA interactions for Protein: Q505D9

Trim67, Tripartite motif-containing protein 67, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim67Q505D9 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim67Q505D9 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim67Q505D9 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim67Q505D9 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim67Q505D9 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim67Q505D9 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim67Q505D9 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim67Q505D9 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim67Q505D9 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim67Q505D9 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim67Q505D9 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim67Q505D9 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim67Q505D9 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim67Q505D9 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim67Q505D9 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim67Q505D9 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim67Q505D9 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim67Q505D9 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim67Q505D9 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim67Q505D9 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim67Q505D9 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim67Q505D9 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim67Q505D9 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim67Q505D9 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim67Q505D9 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim67Q505D9 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim67Q505D9 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim67Q505D9 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim67Q505D9 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim67Q505D9 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim67Q505D9 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim67Q505D9 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim67Q505D9 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim67Q505D9 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim67Q505D9 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim67Q505D9 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim67Q505D9 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim67Q505D9 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim67Q505D9 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim67Q505D9 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim67Q505D9 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim67Q505D9 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim67Q505D9 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim67Q505D9 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim67Q505D9 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim67Q505D9 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim67Q505D9 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim67Q505D9 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim67Q505D9 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim67Q505D9 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim67Q505D9 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim67Q505D9 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim67Q505D9 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim67Q505D9 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim67Q505D9 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim67Q505D9 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim67Q505D9 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim67Q505D9 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim67Q505D9 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim67Q505D9 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim67Q505D9 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim67Q505D9 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim67Q505D9 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim67Q505D9 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim67Q505D9 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim67Q505D9 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim67Q505D9 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim67Q505D9 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim67Q505D9 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim67Q505D9 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim67Q505D9 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim67Q505D9 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim67Q505D9 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim67Q505D9 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim67Q505D9 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim67Q505D9 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim67Q505D9 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim67Q505D9 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim67Q505D9 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim67Q505D9 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim67Q505D9 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim67Q505D9 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim67Q505D9 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim67Q505D9 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim67Q505D9 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim67Q505D9 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim67Q505D9 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim67Q505D9 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim67Q505D9 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim67Q505D9 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim67Q505D9 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim67Q505D9 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim67Q505D9 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim67Q505D9 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim67Q505D9 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim67Q505D9 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim67Q505D9 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim67Q505D9 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim67Q505D9 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim67Q505D9 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms