Protein–RNA interactions for Protein: Q499D5

Zfp235, Zinc finger protein 235, mousemouse

Predictions only

Length 702 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp235Q499D5 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp235Q499D5 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp235Q499D5 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp235Q499D5 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp235Q499D5 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp235Q499D5 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp235Q499D5 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp235Q499D5 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp235Q499D5 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp235Q499D5 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp235Q499D5 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp235Q499D5 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp235Q499D5 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp235Q499D5 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp235Q499D5 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp235Q499D5 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp235Q499D5 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp235Q499D5 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp235Q499D5 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp235Q499D5 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp235Q499D5 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp235Q499D5 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp235Q499D5 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp235Q499D5 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp235Q499D5 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp235Q499D5 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp235Q499D5 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp235Q499D5 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp235Q499D5 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp235Q499D5 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp235Q499D5 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp235Q499D5 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp235Q499D5 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp235Q499D5 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp235Q499D5 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp235Q499D5 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp235Q499D5 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp235Q499D5 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp235Q499D5 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp235Q499D5 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp235Q499D5 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp235Q499D5 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfp235Q499D5 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfp235Q499D5 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfp235Q499D5 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfp235Q499D5 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfp235Q499D5 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfp235Q499D5 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfp235Q499D5 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfp235Q499D5 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfp235Q499D5 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfp235Q499D5 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfp235Q499D5 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfp235Q499D5 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfp235Q499D5 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfp235Q499D5 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfp235Q499D5 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfp235Q499D5 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfp235Q499D5 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfp235Q499D5 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfp235Q499D5 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfp235Q499D5 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfp235Q499D5 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfp235Q499D5 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfp235Q499D5 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfp235Q499D5 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfp235Q499D5 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfp235Q499D5 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfp235Q499D5 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfp235Q499D5 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfp235Q499D5 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfp235Q499D5 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfp235Q499D5 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfp235Q499D5 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfp235Q499D5 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfp235Q499D5 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfp235Q499D5 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfp235Q499D5 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfp235Q499D5 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfp235Q499D5 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfp235Q499D5 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfp235Q499D5 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zfp235Q499D5 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zfp235Q499D5 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zfp235Q499D5 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zfp235Q499D5 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zfp235Q499D5 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zfp235Q499D5 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zfp235Q499D5 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zfp235Q499D5 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zfp235Q499D5 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zfp235Q499D5 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zfp235Q499D5 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zfp235Q499D5 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zfp235Q499D5 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zfp235Q499D5 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zfp235Q499D5 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zfp235Q499D5 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zfp235Q499D5 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zfp235Q499D5 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms