Protein–RNA interactions for Protein: Q499D0

Foxn3, Forkhead box protein N3, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxn3Q499D0 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Foxn3Q499D0 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Foxn3Q499D0 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Foxn3Q499D0 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Foxn3Q499D0 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Foxn3Q499D0 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Foxn3Q499D0 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Foxn3Q499D0 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Foxn3Q499D0 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Foxn3Q499D0 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Foxn3Q499D0 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Foxn3Q499D0 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Foxn3Q499D0 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Foxn3Q499D0 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Foxn3Q499D0 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Foxn3Q499D0 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Foxn3Q499D0 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Foxn3Q499D0 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Foxn3Q499D0 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Foxn3Q499D0 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Foxn3Q499D0 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Foxn3Q499D0 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Foxn3Q499D0 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Foxn3Q499D0 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Foxn3Q499D0 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Foxn3Q499D0 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Foxn3Q499D0 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Foxn3Q499D0 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Foxn3Q499D0 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Foxn3Q499D0 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Foxn3Q499D0 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Foxn3Q499D0 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Foxn3Q499D0 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Foxn3Q499D0 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Foxn3Q499D0 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Foxn3Q499D0 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Foxn3Q499D0 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Foxn3Q499D0 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Foxn3Q499D0 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Foxn3Q499D0 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Foxn3Q499D0 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Foxn3Q499D0 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Foxn3Q499D0 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Foxn3Q499D0 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Foxn3Q499D0 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Foxn3Q499D0 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Foxn3Q499D0 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Foxn3Q499D0 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Foxn3Q499D0 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Foxn3Q499D0 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Foxn3Q499D0 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Foxn3Q499D0 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Foxn3Q499D0 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Foxn3Q499D0 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Foxn3Q499D0 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Foxn3Q499D0 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Foxn3Q499D0 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Foxn3Q499D0 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Foxn3Q499D0 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Foxn3Q499D0 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Foxn3Q499D0 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Foxn3Q499D0 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Foxn3Q499D0 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Foxn3Q499D0 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Foxn3Q499D0 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Foxn3Q499D0 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Foxn3Q499D0 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Foxn3Q499D0 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Foxn3Q499D0 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Foxn3Q499D0 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Foxn3Q499D0 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Foxn3Q499D0 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Foxn3Q499D0 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Foxn3Q499D0 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Foxn3Q499D0 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Foxn3Q499D0 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Foxn3Q499D0 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Foxn3Q499D0 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Foxn3Q499D0 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Foxn3Q499D0 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Foxn3Q499D0 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Foxn3Q499D0 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Foxn3Q499D0 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Foxn3Q499D0 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Foxn3Q499D0 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Foxn3Q499D0 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Foxn3Q499D0 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Foxn3Q499D0 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Foxn3Q499D0 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Foxn3Q499D0 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Foxn3Q499D0 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Foxn3Q499D0 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Foxn3Q499D0 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Foxn3Q499D0 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Foxn3Q499D0 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Foxn3Q499D0 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Foxn3Q499D0 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Foxn3Q499D0 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Foxn3Q499D0 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Foxn3Q499D0 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms