Protein–RNA interactions for Protein: Q497I4

Krt35, Keratin, type I cuticular Ha5, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt35Q497I4 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Krt35Q497I4 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Krt35Q497I4 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Krt35Q497I4 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Krt35Q497I4 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Krt35Q497I4 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Krt35Q497I4 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Krt35Q497I4 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Krt35Q497I4 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Krt35Q497I4 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Krt35Q497I4 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Krt35Q497I4 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Krt35Q497I4 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Krt35Q497I4 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Krt35Q497I4 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Krt35Q497I4 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Krt35Q497I4 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Krt35Q497I4 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Krt35Q497I4 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Krt35Q497I4 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Krt35Q497I4 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Krt35Q497I4 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Krt35Q497I4 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Krt35Q497I4 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Krt35Q497I4 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Krt35Q497I4 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Krt35Q497I4 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Krt35Q497I4 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Krt35Q497I4 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Krt35Q497I4 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Krt35Q497I4 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Krt35Q497I4 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Krt35Q497I4 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Krt35Q497I4 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Krt35Q497I4 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Krt35Q497I4 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Krt35Q497I4 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Krt35Q497I4 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Krt35Q497I4 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Krt35Q497I4 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Krt35Q497I4 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Krt35Q497I4 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Krt35Q497I4 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Krt35Q497I4 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Krt35Q497I4 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Krt35Q497I4 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Krt35Q497I4 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Krt35Q497I4 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Krt35Q497I4 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Krt35Q497I4 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Krt35Q497I4 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Krt35Q497I4 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Krt35Q497I4 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Krt35Q497I4 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Krt35Q497I4 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Krt35Q497I4 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Krt35Q497I4 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Krt35Q497I4 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Krt35Q497I4 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Krt35Q497I4 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Krt35Q497I4 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Krt35Q497I4 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Krt35Q497I4 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Krt35Q497I4 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Krt35Q497I4 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Krt35Q497I4 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Krt35Q497I4 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Krt35Q497I4 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Krt35Q497I4 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Krt35Q497I4 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Krt35Q497I4 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Krt35Q497I4 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Krt35Q497I4 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Krt35Q497I4 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Krt35Q497I4 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Krt35Q497I4 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Krt35Q497I4 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Krt35Q497I4 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Krt35Q497I4 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Krt35Q497I4 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Krt35Q497I4 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Krt35Q497I4 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Krt35Q497I4 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Krt35Q497I4 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Krt35Q497I4 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Krt35Q497I4 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Krt35Q497I4 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Krt35Q497I4 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt35Q497I4 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt35Q497I4 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt35Q497I4 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt35Q497I4 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt35Q497I4 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt35Q497I4 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt35Q497I4 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt35Q497I4 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt35Q497I4 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt35Q497I4 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt35Q497I4 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt35Q497I4 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms