Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3V9

Carmil2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carmil2Q3V3V9 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Carmil2Q3V3V9 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Carmil2Q3V3V9 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Carmil2Q3V3V9 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Carmil2Q3V3V9 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Carmil2Q3V3V9 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Carmil2Q3V3V9 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Carmil2Q3V3V9 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Carmil2Q3V3V9 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Carmil2Q3V3V9 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Carmil2Q3V3V9 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Carmil2Q3V3V9 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Carmil2Q3V3V9 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Carmil2Q3V3V9 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Carmil2Q3V3V9 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Carmil2Q3V3V9 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Carmil2Q3V3V9 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Carmil2Q3V3V9 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Carmil2Q3V3V9 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Carmil2Q3V3V9 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Carmil2Q3V3V9 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Carmil2Q3V3V9 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Carmil2Q3V3V9 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Carmil2Q3V3V9 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Carmil2Q3V3V9 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Carmil2Q3V3V9 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Carmil2Q3V3V9 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Carmil2Q3V3V9 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Carmil2Q3V3V9 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Carmil2Q3V3V9 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Carmil2Q3V3V9 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Carmil2Q3V3V9 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Carmil2Q3V3V9 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Carmil2Q3V3V9 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Carmil2Q3V3V9 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Carmil2Q3V3V9 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Carmil2Q3V3V9 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Carmil2Q3V3V9 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Carmil2Q3V3V9 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Carmil2Q3V3V9 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Carmil2Q3V3V9 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Carmil2Q3V3V9 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Carmil2Q3V3V9 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Carmil2Q3V3V9 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Carmil2Q3V3V9 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Carmil2Q3V3V9 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Carmil2Q3V3V9 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Carmil2Q3V3V9 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Carmil2Q3V3V9 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Carmil2Q3V3V9 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Carmil2Q3V3V9 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Carmil2Q3V3V9 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Carmil2Q3V3V9 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Carmil2Q3V3V9 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Carmil2Q3V3V9 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Carmil2Q3V3V9 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Carmil2Q3V3V9 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Carmil2Q3V3V9 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Carmil2Q3V3V9 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Carmil2Q3V3V9 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Carmil2Q3V3V9 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Carmil2Q3V3V9 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Carmil2Q3V3V9 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Carmil2Q3V3V9 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Carmil2Q3V3V9 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Carmil2Q3V3V9 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Carmil2Q3V3V9 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Carmil2Q3V3V9 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Carmil2Q3V3V9 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Carmil2Q3V3V9 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Carmil2Q3V3V9 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Carmil2Q3V3V9 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Carmil2Q3V3V9 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Carmil2Q3V3V9 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Carmil2Q3V3V9 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Carmil2Q3V3V9 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Carmil2Q3V3V9 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Carmil2Q3V3V9 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Carmil2Q3V3V9 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Carmil2Q3V3V9 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Carmil2Q3V3V9 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Carmil2Q3V3V9 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Carmil2Q3V3V9 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Carmil2Q3V3V9 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Carmil2Q3V3V9 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Carmil2Q3V3V9 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Carmil2Q3V3V9 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Carmil2Q3V3V9 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Carmil2Q3V3V9 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Carmil2Q3V3V9 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Carmil2Q3V3V9 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Carmil2Q3V3V9 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Carmil2Q3V3V9 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Carmil2Q3V3V9 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Carmil2Q3V3V9 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Carmil2Q3V3V9 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Carmil2Q3V3V9 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Carmil2Q3V3V9 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Carmil2Q3V3V9 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Carmil2Q3V3V9 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms