Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3Q4

Pydc3, Pyrin domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pydc3Q3V3Q4 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pydc3Q3V3Q4 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pydc3Q3V3Q4 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pydc3Q3V3Q4 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pydc3Q3V3Q4 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pydc3Q3V3Q4 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pydc3Q3V3Q4 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pydc3Q3V3Q4 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pydc3Q3V3Q4 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pydc3Q3V3Q4 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pydc3Q3V3Q4 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pydc3Q3V3Q4 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pydc3Q3V3Q4 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pydc3Q3V3Q4 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pydc3Q3V3Q4 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pydc3Q3V3Q4 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pydc3Q3V3Q4 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pydc3Q3V3Q4 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pydc3Q3V3Q4 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pydc3Q3V3Q4 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pydc3Q3V3Q4 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pydc3Q3V3Q4 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pydc3Q3V3Q4 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pydc3Q3V3Q4 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pydc3Q3V3Q4 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pydc3Q3V3Q4 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pydc3Q3V3Q4 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pydc3Q3V3Q4 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pydc3Q3V3Q4 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pydc3Q3V3Q4 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pydc3Q3V3Q4 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pydc3Q3V3Q4 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pydc3Q3V3Q4 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pydc3Q3V3Q4 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pydc3Q3V3Q4 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pydc3Q3V3Q4 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pydc3Q3V3Q4 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pydc3Q3V3Q4 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pydc3Q3V3Q4 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pydc3Q3V3Q4 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pydc3Q3V3Q4 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pydc3Q3V3Q4 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pydc3Q3V3Q4 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pydc3Q3V3Q4 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pydc3Q3V3Q4 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pydc3Q3V3Q4 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pydc3Q3V3Q4 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pydc3Q3V3Q4 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pydc3Q3V3Q4 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pydc3Q3V3Q4 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pydc3Q3V3Q4 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pydc3Q3V3Q4 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pydc3Q3V3Q4 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pydc3Q3V3Q4 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pydc3Q3V3Q4 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pydc3Q3V3Q4 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pydc3Q3V3Q4 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pydc3Q3V3Q4 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pydc3Q3V3Q4 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pydc3Q3V3Q4 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pydc3Q3V3Q4 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pydc3Q3V3Q4 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pydc3Q3V3Q4 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pydc3Q3V3Q4 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pydc3Q3V3Q4 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pydc3Q3V3Q4 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pydc3Q3V3Q4 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pydc3Q3V3Q4 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pydc3Q3V3Q4 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pydc3Q3V3Q4 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pydc3Q3V3Q4 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pydc3Q3V3Q4 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pydc3Q3V3Q4 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pydc3Q3V3Q4 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pydc3Q3V3Q4 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pydc3Q3V3Q4 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pydc3Q3V3Q4 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pydc3Q3V3Q4 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pydc3Q3V3Q4 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pydc3Q3V3Q4 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pydc3Q3V3Q4 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pydc3Q3V3Q4 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pydc3Q3V3Q4 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pydc3Q3V3Q4 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pydc3Q3V3Q4 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pydc3Q3V3Q4 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pydc3Q3V3Q4 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pydc3Q3V3Q4 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pydc3Q3V3Q4 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pydc3Q3V3Q4 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pydc3Q3V3Q4 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pydc3Q3V3Q4 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pydc3Q3V3Q4 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pydc3Q3V3Q4 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pydc3Q3V3Q4 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pydc3Q3V3Q4 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pydc3Q3V3Q4 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pydc3Q3V3Q4 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pydc3Q3V3Q4 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pydc3Q3V3Q4 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms