Protein–RNA interactions for Protein: Q3V118

Ccdc185, Coiled-coil domain-containing 185, mousemouse

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Length 621 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc185Q3V118 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Ccdc185Q3V118 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc185Q3V118 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc185Q3V118 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc185Q3V118 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc185Q3V118 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Ccdc185Q3V118 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc185Q3V118 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Ccdc185Q3V118 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Ccdc185Q3V118 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc185Q3V118 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc185Q3V118 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc185Q3V118 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Ccdc185Q3V118 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Ccdc185Q3V118 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc185Q3V118 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Ccdc185Q3V118 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc185Q3V118 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc185Q3V118 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc185Q3V118 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Ccdc185Q3V118 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc185Q3V118 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc185Q3V118 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Ccdc185Q3V118 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc185Q3V118 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Ccdc185Q3V118 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
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