Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0H9

4930596D02Rik, RIKEN cDNA 4930596D02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930596D02RikQ3V0H9 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
4930596D02RikQ3V0H9 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
4930596D02RikQ3V0H9 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
4930596D02RikQ3V0H9 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
4930596D02RikQ3V0H9 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
4930596D02RikQ3V0H9 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
4930596D02RikQ3V0H9 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
4930596D02RikQ3V0H9 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
4930596D02RikQ3V0H9 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
4930596D02RikQ3V0H9 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
4930596D02RikQ3V0H9 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
4930596D02RikQ3V0H9 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
4930596D02RikQ3V0H9 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
4930596D02RikQ3V0H9 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
4930596D02RikQ3V0H9 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
4930596D02RikQ3V0H9 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
4930596D02RikQ3V0H9 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
4930596D02RikQ3V0H9 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
4930596D02RikQ3V0H9 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
4930596D02RikQ3V0H9 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
4930596D02RikQ3V0H9 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
4930596D02RikQ3V0H9 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
4930596D02RikQ3V0H9 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
4930596D02RikQ3V0H9 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
4930596D02RikQ3V0H9 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
4930596D02RikQ3V0H9 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
4930596D02RikQ3V0H9 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
4930596D02RikQ3V0H9 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
4930596D02RikQ3V0H9 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
4930596D02RikQ3V0H9 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
4930596D02RikQ3V0H9 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
4930596D02RikQ3V0H9 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
4930596D02RikQ3V0H9 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
4930596D02RikQ3V0H9 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
4930596D02RikQ3V0H9 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
4930596D02RikQ3V0H9 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
4930596D02RikQ3V0H9 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
4930596D02RikQ3V0H9 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
4930596D02RikQ3V0H9 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
4930596D02RikQ3V0H9 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
4930596D02RikQ3V0H9 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
4930596D02RikQ3V0H9 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
4930596D02RikQ3V0H9 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
4930596D02RikQ3V0H9 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
4930596D02RikQ3V0H9 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
4930596D02RikQ3V0H9 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
4930596D02RikQ3V0H9 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
4930596D02RikQ3V0H9 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
4930596D02RikQ3V0H9 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
4930596D02RikQ3V0H9 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
4930596D02RikQ3V0H9 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
4930596D02RikQ3V0H9 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
4930596D02RikQ3V0H9 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
4930596D02RikQ3V0H9 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
4930596D02RikQ3V0H9 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
4930596D02RikQ3V0H9 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
4930596D02RikQ3V0H9 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
4930596D02RikQ3V0H9 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
4930596D02RikQ3V0H9 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
4930596D02RikQ3V0H9 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
4930596D02RikQ3V0H9 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
4930596D02RikQ3V0H9 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
4930596D02RikQ3V0H9 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
4930596D02RikQ3V0H9 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
4930596D02RikQ3V0H9 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
4930596D02RikQ3V0H9 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
4930596D02RikQ3V0H9 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
4930596D02RikQ3V0H9 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
4930596D02RikQ3V0H9 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
4930596D02RikQ3V0H9 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
4930596D02RikQ3V0H9 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
4930596D02RikQ3V0H9 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
4930596D02RikQ3V0H9 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
4930596D02RikQ3V0H9 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
4930596D02RikQ3V0H9 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
4930596D02RikQ3V0H9 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
4930596D02RikQ3V0H9 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
4930596D02RikQ3V0H9 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
4930596D02RikQ3V0H9 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
4930596D02RikQ3V0H9 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
4930596D02RikQ3V0H9 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
4930596D02RikQ3V0H9 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
4930596D02RikQ3V0H9 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
4930596D02RikQ3V0H9 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
4930596D02RikQ3V0H9 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
4930596D02RikQ3V0H9 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
4930596D02RikQ3V0H9 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
4930596D02RikQ3V0H9 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
4930596D02RikQ3V0H9 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
4930596D02RikQ3V0H9 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
4930596D02RikQ3V0H9 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
4930596D02RikQ3V0H9 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
4930596D02RikQ3V0H9 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms