Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0G7

Garnl3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Garnl3Q3V0G7 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Garnl3Q3V0G7 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Garnl3Q3V0G7 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Garnl3Q3V0G7 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Garnl3Q3V0G7 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Garnl3Q3V0G7 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Garnl3Q3V0G7 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Garnl3Q3V0G7 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Garnl3Q3V0G7 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Garnl3Q3V0G7 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Garnl3Q3V0G7 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Garnl3Q3V0G7 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Garnl3Q3V0G7 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Garnl3Q3V0G7 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Garnl3Q3V0G7 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Garnl3Q3V0G7 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Garnl3Q3V0G7 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Garnl3Q3V0G7 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Garnl3Q3V0G7 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Garnl3Q3V0G7 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Garnl3Q3V0G7 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Garnl3Q3V0G7 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Garnl3Q3V0G7 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Garnl3Q3V0G7 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Garnl3Q3V0G7 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Garnl3Q3V0G7 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Garnl3Q3V0G7 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Garnl3Q3V0G7 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Garnl3Q3V0G7 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Garnl3Q3V0G7 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Garnl3Q3V0G7 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Garnl3Q3V0G7 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Garnl3Q3V0G7 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Garnl3Q3V0G7 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Garnl3Q3V0G7 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Garnl3Q3V0G7 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Garnl3Q3V0G7 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Garnl3Q3V0G7 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Garnl3Q3V0G7 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Garnl3Q3V0G7 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Garnl3Q3V0G7 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Garnl3Q3V0G7 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Garnl3Q3V0G7 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Garnl3Q3V0G7 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Garnl3Q3V0G7 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Garnl3Q3V0G7 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Garnl3Q3V0G7 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Garnl3Q3V0G7 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Garnl3Q3V0G7 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Garnl3Q3V0G7 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Garnl3Q3V0G7 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Garnl3Q3V0G7 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Garnl3Q3V0G7 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Garnl3Q3V0G7 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Garnl3Q3V0G7 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Garnl3Q3V0G7 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Garnl3Q3V0G7 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Garnl3Q3V0G7 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Garnl3Q3V0G7 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Garnl3Q3V0G7 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Garnl3Q3V0G7 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Garnl3Q3V0G7 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Garnl3Q3V0G7 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Garnl3Q3V0G7 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Garnl3Q3V0G7 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Garnl3Q3V0G7 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Garnl3Q3V0G7 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Garnl3Q3V0G7 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Garnl3Q3V0G7 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Garnl3Q3V0G7 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Garnl3Q3V0G7 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Garnl3Q3V0G7 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Garnl3Q3V0G7 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Garnl3Q3V0G7 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Garnl3Q3V0G7 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Garnl3Q3V0G7 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Garnl3Q3V0G7 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Garnl3Q3V0G7 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Garnl3Q3V0G7 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Garnl3Q3V0G7 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Garnl3Q3V0G7 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Garnl3Q3V0G7 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Garnl3Q3V0G7 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Garnl3Q3V0G7 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Garnl3Q3V0G7 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Garnl3Q3V0G7 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Garnl3Q3V0G7 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Garnl3Q3V0G7 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Garnl3Q3V0G7 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Garnl3Q3V0G7 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Garnl3Q3V0G7 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Garnl3Q3V0G7 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Garnl3Q3V0G7 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Garnl3Q3V0G7 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Garnl3Q3V0G7 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Garnl3Q3V0G7 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Garnl3Q3V0G7 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Garnl3Q3V0G7 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Garnl3Q3V0G7 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Garnl3Q3V0G7 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms