Protein–RNA interactions for Protein: Q3V016

Hipk4, Homeodomain-interacting protein kinase 4, mousemouse

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hipk4Q3V016 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hipk4Q3V016 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hipk4Q3V016 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hipk4Q3V016 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hipk4Q3V016 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Hipk4Q3V016 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hipk4Q3V016 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hipk4Q3V016 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hipk4Q3V016 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hipk4Q3V016 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hipk4Q3V016 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hipk4Q3V016 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hipk4Q3V016 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Hipk4Q3V016 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Hipk4Q3V016 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Hipk4Q3V016 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hipk4Q3V016 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hipk4Q3V016 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hipk4Q3V016 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hipk4Q3V016 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hipk4Q3V016 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hipk4Q3V016 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hipk4Q3V016 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hipk4Q3V016 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hipk4Q3V016 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hipk4Q3V016 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hipk4Q3V016 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hipk4Q3V016 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hipk4Q3V016 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hipk4Q3V016 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hipk4Q3V016 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hipk4Q3V016 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hipk4Q3V016 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hipk4Q3V016 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hipk4Q3V016 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hipk4Q3V016 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hipk4Q3V016 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hipk4Q3V016 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hipk4Q3V016 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hipk4Q3V016 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hipk4Q3V016 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hipk4Q3V016 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hipk4Q3V016 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hipk4Q3V016 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hipk4Q3V016 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hipk4Q3V016 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hipk4Q3V016 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hipk4Q3V016 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hipk4Q3V016 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hipk4Q3V016 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hipk4Q3V016 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hipk4Q3V016 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hipk4Q3V016 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hipk4Q3V016 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hipk4Q3V016 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Hipk4Q3V016 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hipk4Q3V016 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hipk4Q3V016 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hipk4Q3V016 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hipk4Q3V016 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hipk4Q3V016 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hipk4Q3V016 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hipk4Q3V016 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hipk4Q3V016 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hipk4Q3V016 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hipk4Q3V016 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hipk4Q3V016 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hipk4Q3V016 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hipk4Q3V016 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hipk4Q3V016 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hipk4Q3V016 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hipk4Q3V016 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hipk4Q3V016 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hipk4Q3V016 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hipk4Q3V016 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hipk4Q3V016 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hipk4Q3V016 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hipk4Q3V016 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hipk4Q3V016 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hipk4Q3V016 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Hipk4Q3V016 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hipk4Q3V016 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hipk4Q3V016 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hipk4Q3V016 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hipk4Q3V016 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hipk4Q3V016 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hipk4Q3V016 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Hipk4Q3V016 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hipk4Q3V016 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hipk4Q3V016 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hipk4Q3V016 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hipk4Q3V016 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hipk4Q3V016 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hipk4Q3V016 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hipk4Q3V016 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hipk4Q3V016 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hipk4Q3V016 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hipk4Q3V016 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hipk4Q3V016 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hipk4Q3V016 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 118.9 ms