Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYG1

Ccdc160, Coiled-coil domain-containing protein 160, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc160Q3UYG1 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc160Q3UYG1 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc160Q3UYG1 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc160Q3UYG1 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc160Q3UYG1 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc160Q3UYG1 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc160Q3UYG1 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc160Q3UYG1 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc160Q3UYG1 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc160Q3UYG1 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc160Q3UYG1 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc160Q3UYG1 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc160Q3UYG1 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc160Q3UYG1 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc160Q3UYG1 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc160Q3UYG1 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc160Q3UYG1 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc160Q3UYG1 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc160Q3UYG1 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc160Q3UYG1 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc160Q3UYG1 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc160Q3UYG1 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc160Q3UYG1 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc160Q3UYG1 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc160Q3UYG1 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc160Q3UYG1 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc160Q3UYG1 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc160Q3UYG1 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc160Q3UYG1 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc160Q3UYG1 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc160Q3UYG1 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc160Q3UYG1 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc160Q3UYG1 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc160Q3UYG1 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc160Q3UYG1 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc160Q3UYG1 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc160Q3UYG1 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc160Q3UYG1 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc160Q3UYG1 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc160Q3UYG1 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc160Q3UYG1 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc160Q3UYG1 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc160Q3UYG1 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc160Q3UYG1 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc160Q3UYG1 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc160Q3UYG1 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc160Q3UYG1 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc160Q3UYG1 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc160Q3UYG1 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc160Q3UYG1 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc160Q3UYG1 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc160Q3UYG1 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc160Q3UYG1 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc160Q3UYG1 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc160Q3UYG1 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc160Q3UYG1 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc160Q3UYG1 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc160Q3UYG1 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc160Q3UYG1 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc160Q3UYG1 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc160Q3UYG1 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc160Q3UYG1 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc160Q3UYG1 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc160Q3UYG1 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc160Q3UYG1 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc160Q3UYG1 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc160Q3UYG1 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc160Q3UYG1 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc160Q3UYG1 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc160Q3UYG1 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc160Q3UYG1 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc160Q3UYG1 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc160Q3UYG1 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc160Q3UYG1 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc160Q3UYG1 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc160Q3UYG1 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc160Q3UYG1 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc160Q3UYG1 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc160Q3UYG1 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc160Q3UYG1 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc160Q3UYG1 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc160Q3UYG1 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc160Q3UYG1 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc160Q3UYG1 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc160Q3UYG1 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc160Q3UYG1 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc160Q3UYG1 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc160Q3UYG1 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc160Q3UYG1 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc160Q3UYG1 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc160Q3UYG1 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc160Q3UYG1 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc160Q3UYG1 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc160Q3UYG1 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc160Q3UYG1 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc160Q3UYG1 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc160Q3UYG1 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc160Q3UYG1 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc160Q3UYG1 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc160Q3UYG1 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms