Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW50

Gm27235, Predicted gene 27235, mousemouse

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm27235Q3UW50 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm27235Q3UW50 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm27235Q3UW50 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm27235Q3UW50 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm27235Q3UW50 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm27235Q3UW50 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm27235Q3UW50 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm27235Q3UW50 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm27235Q3UW50 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm27235Q3UW50 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm27235Q3UW50 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm27235Q3UW50 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm27235Q3UW50 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm27235Q3UW50 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm27235Q3UW50 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm27235Q3UW50 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm27235Q3UW50 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm27235Q3UW50 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm27235Q3UW50 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm27235Q3UW50 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm27235Q3UW50 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm27235Q3UW50 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm27235Q3UW50 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm27235Q3UW50 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm27235Q3UW50 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm27235Q3UW50 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm27235Q3UW50 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm27235Q3UW50 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm27235Q3UW50 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm27235Q3UW50 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm27235Q3UW50 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm27235Q3UW50 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm27235Q3UW50 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm27235Q3UW50 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm27235Q3UW50 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm27235Q3UW50 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm27235Q3UW50 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm27235Q3UW50 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm27235Q3UW50 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm27235Q3UW50 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm27235Q3UW50 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm27235Q3UW50 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm27235Q3UW50 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm27235Q3UW50 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm27235Q3UW50 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm27235Q3UW50 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm27235Q3UW50 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm27235Q3UW50 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm27235Q3UW50 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm27235Q3UW50 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm27235Q3UW50 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm27235Q3UW50 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm27235Q3UW50 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm27235Q3UW50 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm27235Q3UW50 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm27235Q3UW50 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm27235Q3UW50 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm27235Q3UW50 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm27235Q3UW50 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm27235Q3UW50 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Gm27235Q3UW50 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm27235Q3UW50 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm27235Q3UW50 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm27235Q3UW50 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm27235Q3UW50 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm27235Q3UW50 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm27235Q3UW50 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm27235Q3UW50 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm27235Q3UW50 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm27235Q3UW50 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm27235Q3UW50 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm27235Q3UW50 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm27235Q3UW50 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm27235Q3UW50 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm27235Q3UW50 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm27235Q3UW50 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm27235Q3UW50 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm27235Q3UW50 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm27235Q3UW50 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm27235Q3UW50 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm27235Q3UW50 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm27235Q3UW50 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm27235Q3UW50 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm27235Q3UW50 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm27235Q3UW50 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm27235Q3UW50 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm27235Q3UW50 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm27235Q3UW50 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm27235Q3UW50 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm27235Q3UW50 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm27235Q3UW50 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm27235Q3UW50 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm27235Q3UW50 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm27235Q3UW50 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm27235Q3UW50 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm27235Q3UW50 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm27235Q3UW50 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm27235Q3UW50 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm27235Q3UW50 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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