Protein–RNA interactions for Protein: Q3UUV5

Skap1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap1Q3UUV5 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Skap1Q3UUV5 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Skap1Q3UUV5 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Skap1Q3UUV5 Defa-ps4-201ENSMUST00000118021 183 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Skap1Q3UUV5 Gm15904-201ENSMUST00000154515 487 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Skap1Q3UUV5 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Skap1Q3UUV5 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Skap1Q3UUV5 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Skap1Q3UUV5 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Skap1Q3UUV5 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Skap1Q3UUV5 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Skap1Q3UUV5 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Skap1Q3UUV5 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Skap1Q3UUV5 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Skap1Q3UUV5 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Skap1Q3UUV5 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Skap1Q3UUV5 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Skap1Q3UUV5 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Skap1Q3UUV5 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Skap1Q3UUV5 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Skap1Q3UUV5 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Skap1Q3UUV5 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Skap1Q3UUV5 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Skap1Q3UUV5 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Skap1Q3UUV5 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Skap1Q3UUV5 Synj2bp-202ENSMUST00000114201 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Skap1Q3UUV5 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Skap1Q3UUV5 Gm37436-201ENSMUST00000193842 1085 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Skap1Q3UUV5 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Skap1Q3UUV5 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Skap1Q3UUV5 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Skap1Q3UUV5 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Skap1Q3UUV5 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Skap1Q3UUV5 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Skap1Q3UUV5 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Skap1Q3UUV5 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Skap1Q3UUV5 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Skap1Q3UUV5 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Skap1Q3UUV5 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Skap1Q3UUV5 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Skap1Q3UUV5 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Skap1Q3UUV5 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Skap1Q3UUV5 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Skap1Q3UUV5 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Skap1Q3UUV5 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Skap1Q3UUV5 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Skap1Q3UUV5 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Skap1Q3UUV5 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Skap1Q3UUV5 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Skap1Q3UUV5 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Skap1Q3UUV5 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Skap1Q3UUV5 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Skap1Q3UUV5 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Skap1Q3UUV5 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Skap1Q3UUV5 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Skap1Q3UUV5 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Skap1Q3UUV5 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Skap1Q3UUV5 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Skap1Q3UUV5 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Skap1Q3UUV5 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Skap1Q3UUV5 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Skap1Q3UUV5 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Skap1Q3UUV5 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Skap1Q3UUV5 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Skap1Q3UUV5 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Skap1Q3UUV5 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Skap1Q3UUV5 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Skap1Q3UUV5 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Skap1Q3UUV5 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Skap1Q3UUV5 Gm26952-201ENSMUST00000181996 409 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Skap1Q3UUV5 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Skap1Q3UUV5 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Skap1Q3UUV5 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Skap1Q3UUV5 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Skap1Q3UUV5 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Skap1Q3UUV5 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Skap1Q3UUV5 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Skap1Q3UUV5 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Skap1Q3UUV5 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Skap1Q3UUV5 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Skap1Q3UUV5 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Skap1Q3UUV5 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Skap1Q3UUV5 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Skap1Q3UUV5 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Skap1Q3UUV5 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Skap1Q3UUV5 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Skap1Q3UUV5 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Skap1Q3UUV5 Cd59a-201ENSMUST00000040423 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Skap1Q3UUV5 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Skap1Q3UUV5 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Skap1Q3UUV5 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Skap1Q3UUV5 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Skap1Q3UUV5 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Skap1Q3UUV5 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Skap1Q3UUV5 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Skap1Q3UUV5 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Skap1Q3UUV5 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Skap1Q3UUV5 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Skap1Q3UUV5 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Skap1Q3UUV5 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms