Protein–RNA interactions for Protein: Q3UTY6

Thsd4, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,018 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thsd4Q3UTY6 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Thsd4Q3UTY6 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Thsd4Q3UTY6 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Thsd4Q3UTY6 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Thsd4Q3UTY6 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Thsd4Q3UTY6 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Thsd4Q3UTY6 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Thsd4Q3UTY6 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Thsd4Q3UTY6 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Thsd4Q3UTY6 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Thsd4Q3UTY6 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Thsd4Q3UTY6 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Thsd4Q3UTY6 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Thsd4Q3UTY6 Olfr293-201ENSMUST00000081474 1011 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Thsd4Q3UTY6 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Thsd4Q3UTY6 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Thsd4Q3UTY6 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Thsd4Q3UTY6 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Thsd4Q3UTY6 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Thsd4Q3UTY6 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Thsd4Q3UTY6 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Thsd4Q3UTY6 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Thsd4Q3UTY6 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Thsd4Q3UTY6 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Thsd4Q3UTY6 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Thsd4Q3UTY6 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Thsd4Q3UTY6 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Thsd4Q3UTY6 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Thsd4Q3UTY6 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Thsd4Q3UTY6 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Thsd4Q3UTY6 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Thsd4Q3UTY6 Gm14399-202ENSMUST00000108929 813 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Thsd4Q3UTY6 Gm16140-201ENSMUST00000117191 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Thsd4Q3UTY6 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Thsd4Q3UTY6 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Thsd4Q3UTY6 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Thsd4Q3UTY6 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Thsd4Q3UTY6 Gm16973-201ENSMUST00000180682 1299 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Thsd4Q3UTY6 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Thsd4Q3UTY6 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Thsd4Q3UTY6 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Thsd4Q3UTY6 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Thsd4Q3UTY6 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Thsd4Q3UTY6 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Thsd4Q3UTY6 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Thsd4Q3UTY6 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Thsd4Q3UTY6 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Thsd4Q3UTY6 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Thsd4Q3UTY6 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Thsd4Q3UTY6 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Thsd4Q3UTY6 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Thsd4Q3UTY6 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Thsd4Q3UTY6 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Thsd4Q3UTY6 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Thsd4Q3UTY6 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Thsd4Q3UTY6 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Thsd4Q3UTY6 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Thsd4Q3UTY6 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Thsd4Q3UTY6 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Thsd4Q3UTY6 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Thsd4Q3UTY6 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Thsd4Q3UTY6 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Thsd4Q3UTY6 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Thsd4Q3UTY6 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Thsd4Q3UTY6 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Thsd4Q3UTY6 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Thsd4Q3UTY6 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Thsd4Q3UTY6 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Thsd4Q3UTY6 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Thsd4Q3UTY6 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Thsd4Q3UTY6 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Thsd4Q3UTY6 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Thsd4Q3UTY6 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Thsd4Q3UTY6 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Thsd4Q3UTY6 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Thsd4Q3UTY6 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Thsd4Q3UTY6 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Thsd4Q3UTY6 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Thsd4Q3UTY6 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Thsd4Q3UTY6 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Thsd4Q3UTY6 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Thsd4Q3UTY6 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Thsd4Q3UTY6 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Thsd4Q3UTY6 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Thsd4Q3UTY6 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Thsd4Q3UTY6 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Thsd4Q3UTY6 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Thsd4Q3UTY6 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Thsd4Q3UTY6 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Thsd4Q3UTY6 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Thsd4Q3UTY6 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Thsd4Q3UTY6 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Thsd4Q3UTY6 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Thsd4Q3UTY6 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Thsd4Q3UTY6 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Thsd4Q3UTY6 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Thsd4Q3UTY6 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Thsd4Q3UTY6 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Thsd4Q3UTY6 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Thsd4Q3UTY6 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms