Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm28047Q3US59 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm28047Q3US59 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm28047Q3US59 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm28047Q3US59 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm28047Q3US59 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gm28047Q3US59 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gm28047Q3US59 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm28047Q3US59 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm28047Q3US59 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm28047Q3US59 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm28047Q3US59 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm28047Q3US59 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm28047Q3US59 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm28047Q3US59 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm28047Q3US59 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm28047Q3US59 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm28047Q3US59 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm28047Q3US59 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm28047Q3US59 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm28047Q3US59 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm28047Q3US59 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm28047Q3US59 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm28047Q3US59 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm28047Q3US59 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm28047Q3US59 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm28047Q3US59 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm28047Q3US59 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm28047Q3US59 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm28047Q3US59 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm28047Q3US59 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm28047Q3US59 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm28047Q3US59 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm28047Q3US59 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm28047Q3US59 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm28047Q3US59 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm28047Q3US59 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm28047Q3US59 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm28047Q3US59 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm28047Q3US59 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm28047Q3US59 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm28047Q3US59 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm28047Q3US59 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm28047Q3US59 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm28047Q3US59 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm28047Q3US59 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm28047Q3US59 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm28047Q3US59 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm28047Q3US59 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm28047Q3US59 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm28047Q3US59 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm28047Q3US59 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm28047Q3US59 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm28047Q3US59 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm28047Q3US59 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm28047Q3US59 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm28047Q3US59 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm28047Q3US59 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm28047Q3US59 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm28047Q3US59 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm28047Q3US59 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm28047Q3US59 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm28047Q3US59 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm28047Q3US59 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm28047Q3US59 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm28047Q3US59 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm28047Q3US59 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm28047Q3US59 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm28047Q3US59 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm28047Q3US59 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm28047Q3US59 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm28047Q3US59 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm28047Q3US59 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm28047Q3US59 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm28047Q3US59 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm28047Q3US59 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm28047Q3US59 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm28047Q3US59 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm28047Q3US59 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm28047Q3US59 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm28047Q3US59 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm28047Q3US59 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm28047Q3US59 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm28047Q3US59 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm28047Q3US59 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm28047Q3US59 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm28047Q3US59 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm28047Q3US59 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm28047Q3US59 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm28047Q3US59 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm28047Q3US59 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm28047Q3US59 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm28047Q3US59 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm28047Q3US59 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm28047Q3US59 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm28047Q3US59 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm28047Q3US59 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm28047Q3US59 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm28047Q3US59 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm28047Q3US59 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms