Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Znf48Q3US17 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Znf48Q3US17 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Znf48Q3US17 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Znf48Q3US17 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Znf48Q3US17 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Znf48Q3US17 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Znf48Q3US17 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Znf48Q3US17 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Znf48Q3US17 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Znf48Q3US17 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Znf48Q3US17 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Znf48Q3US17 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Znf48Q3US17 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Znf48Q3US17 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Znf48Q3US17 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Znf48Q3US17 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Znf48Q3US17 Gm6754-201ENSMUST00000117124 913 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Znf48Q3US17 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Znf48Q3US17 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Znf48Q3US17 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Znf48Q3US17 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Znf48Q3US17 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Znf48Q3US17 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Znf48Q3US17 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Znf48Q3US17 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Znf48Q3US17 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Znf48Q3US17 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Znf48Q3US17 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Znf48Q3US17 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Znf48Q3US17 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Znf48Q3US17 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Znf48Q3US17 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Znf48Q3US17 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Znf48Q3US17 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Znf48Q3US17 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Znf48Q3US17 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Znf48Q3US17 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Znf48Q3US17 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Znf48Q3US17 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Znf48Q3US17 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Znf48Q3US17 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Znf48Q3US17 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Znf48Q3US17 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Znf48Q3US17 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Znf48Q3US17 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Znf48Q3US17 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Znf48Q3US17 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Znf48Q3US17 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Znf48Q3US17 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Znf48Q3US17 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Znf48Q3US17 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Znf48Q3US17 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Znf48Q3US17 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Znf48Q3US17 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Znf48Q3US17 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Znf48Q3US17 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Znf48Q3US17 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Znf48Q3US17 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Znf48Q3US17 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Znf48Q3US17 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Znf48Q3US17 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Znf48Q3US17 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Znf48Q3US17 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Znf48Q3US17 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Znf48Q3US17 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Znf48Q3US17 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Znf48Q3US17 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Znf48Q3US17 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Znf48Q3US17 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Znf48Q3US17 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Znf48Q3US17 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Znf48Q3US17 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Znf48Q3US17 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Znf48Q3US17 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Znf48Q3US17 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Znf48Q3US17 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Znf48Q3US17 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Znf48Q3US17 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Znf48Q3US17 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Znf48Q3US17 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Znf48Q3US17 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Znf48Q3US17 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Znf48Q3US17 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Znf48Q3US17 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Znf48Q3US17 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Znf48Q3US17 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Znf48Q3US17 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Znf48Q3US17 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Znf48Q3US17 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Znf48Q3US17 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Znf48Q3US17 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Znf48Q3US17 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Znf48Q3US17 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Znf48Q3US17 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Znf48Q3US17 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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