Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPW2

Elf3, ETS-related transcription factor Elf-3, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elf3Q3UPW2 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Elf3Q3UPW2 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Elf3Q3UPW2 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Elf3Q3UPW2 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Elf3Q3UPW2 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Elf3Q3UPW2 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Elf3Q3UPW2 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Elf3Q3UPW2 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Elf3Q3UPW2 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Elf3Q3UPW2 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Elf3Q3UPW2 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Elf3Q3UPW2 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Elf3Q3UPW2 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Elf3Q3UPW2 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Elf3Q3UPW2 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Elf3Q3UPW2 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Elf3Q3UPW2 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Elf3Q3UPW2 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Elf3Q3UPW2 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Elf3Q3UPW2 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Elf3Q3UPW2 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Elf3Q3UPW2 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Elf3Q3UPW2 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Elf3Q3UPW2 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Elf3Q3UPW2 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Elf3Q3UPW2 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Elf3Q3UPW2 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Elf3Q3UPW2 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Elf3Q3UPW2 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Elf3Q3UPW2 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Elf3Q3UPW2 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Elf3Q3UPW2 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Elf3Q3UPW2 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Elf3Q3UPW2 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Elf3Q3UPW2 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Elf3Q3UPW2 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Elf3Q3UPW2 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Elf3Q3UPW2 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Elf3Q3UPW2 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Elf3Q3UPW2 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Elf3Q3UPW2 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Elf3Q3UPW2 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Elf3Q3UPW2 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Elf3Q3UPW2 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Elf3Q3UPW2 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Elf3Q3UPW2 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Elf3Q3UPW2 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Elf3Q3UPW2 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Elf3Q3UPW2 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Elf3Q3UPW2 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Elf3Q3UPW2 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Elf3Q3UPW2 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Elf3Q3UPW2 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Elf3Q3UPW2 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Elf3Q3UPW2 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Elf3Q3UPW2 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Elf3Q3UPW2 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Elf3Q3UPW2 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Elf3Q3UPW2 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Elf3Q3UPW2 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Elf3Q3UPW2 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Elf3Q3UPW2 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Elf3Q3UPW2 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Elf3Q3UPW2 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Elf3Q3UPW2 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Elf3Q3UPW2 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Elf3Q3UPW2 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Elf3Q3UPW2 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Elf3Q3UPW2 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Elf3Q3UPW2 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Elf3Q3UPW2 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Elf3Q3UPW2 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Elf3Q3UPW2 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Elf3Q3UPW2 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Elf3Q3UPW2 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Elf3Q3UPW2 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Elf3Q3UPW2 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Elf3Q3UPW2 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Elf3Q3UPW2 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Elf3Q3UPW2 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Elf3Q3UPW2 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Elf3Q3UPW2 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Elf3Q3UPW2 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Elf3Q3UPW2 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Elf3Q3UPW2 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Elf3Q3UPW2 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Elf3Q3UPW2 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Elf3Q3UPW2 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Elf3Q3UPW2 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Elf3Q3UPW2 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Elf3Q3UPW2 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Elf3Q3UPW2 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Elf3Q3UPW2 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Elf3Q3UPW2 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Elf3Q3UPW2 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Elf3Q3UPW2 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Elf3Q3UPW2 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Elf3Q3UPW2 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Elf3Q3UPW2 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Elf3Q3UPW2 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms