Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP44

Nhlrc4, NHL-repeat-containing protein 4, mousemouse

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Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc4Q3UP44 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nhlrc4Q3UP44 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nhlrc4Q3UP44 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nhlrc4Q3UP44 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nhlrc4Q3UP44 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nhlrc4Q3UP44 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nhlrc4Q3UP44 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nhlrc4Q3UP44 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nhlrc4Q3UP44 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nhlrc4Q3UP44 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nhlrc4Q3UP44 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Nhlrc4Q3UP44 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nhlrc4Q3UP44 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nhlrc4Q3UP44 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nhlrc4Q3UP44 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nhlrc4Q3UP44 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nhlrc4Q3UP44 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nhlrc4Q3UP44 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nhlrc4Q3UP44 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nhlrc4Q3UP44 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nhlrc4Q3UP44 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nhlrc4Q3UP44 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nhlrc4Q3UP44 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nhlrc4Q3UP44 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nhlrc4Q3UP44 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nhlrc4Q3UP44 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nhlrc4Q3UP44 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nhlrc4Q3UP44 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nhlrc4Q3UP44 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nhlrc4Q3UP44 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nhlrc4Q3UP44 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nhlrc4Q3UP44 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nhlrc4Q3UP44 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nhlrc4Q3UP44 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nhlrc4Q3UP44 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nhlrc4Q3UP44 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nhlrc4Q3UP44 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nhlrc4Q3UP44 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nhlrc4Q3UP44 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nhlrc4Q3UP44 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nhlrc4Q3UP44 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nhlrc4Q3UP44 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nhlrc4Q3UP44 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nhlrc4Q3UP44 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nhlrc4Q3UP44 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nhlrc4Q3UP44 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nhlrc4Q3UP44 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nhlrc4Q3UP44 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nhlrc4Q3UP44 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nhlrc4Q3UP44 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nhlrc4Q3UP44 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nhlrc4Q3UP44 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nhlrc4Q3UP44 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nhlrc4Q3UP44 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nhlrc4Q3UP44 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nhlrc4Q3UP44 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nhlrc4Q3UP44 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nhlrc4Q3UP44 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nhlrc4Q3UP44 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nhlrc4Q3UP44 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nhlrc4Q3UP44 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nhlrc4Q3UP44 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nhlrc4Q3UP44 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nhlrc4Q3UP44 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nhlrc4Q3UP44 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nhlrc4Q3UP44 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nhlrc4Q3UP44 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nhlrc4Q3UP44 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nhlrc4Q3UP44 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nhlrc4Q3UP44 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nhlrc4Q3UP44 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nhlrc4Q3UP44 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nhlrc4Q3UP44 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nhlrc4Q3UP44 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nhlrc4Q3UP44 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nhlrc4Q3UP44 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nhlrc4Q3UP44 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nhlrc4Q3UP44 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nhlrc4Q3UP44 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nhlrc4Q3UP44 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nhlrc4Q3UP44 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nhlrc4Q3UP44 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nhlrc4Q3UP44 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Nhlrc4Q3UP44 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nhlrc4Q3UP44 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nhlrc4Q3UP44 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nhlrc4Q3UP44 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nhlrc4Q3UP44 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nhlrc4Q3UP44 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Nhlrc4Q3UP44 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nhlrc4Q3UP44 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Nhlrc4Q3UP44 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nhlrc4Q3UP44 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nhlrc4Q3UP44 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nhlrc4Q3UP44 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nhlrc4Q3UP44 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nhlrc4Q3UP44 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nhlrc4Q3UP44 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nhlrc4Q3UP44 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nhlrc4Q3UP44 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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