Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmem253Q3UNB8 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmem253Q3UNB8 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmem253Q3UNB8 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmem253Q3UNB8 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmem253Q3UNB8 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmem253Q3UNB8 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmem253Q3UNB8 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmem253Q3UNB8 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmem253Q3UNB8 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmem253Q3UNB8 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmem253Q3UNB8 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmem253Q3UNB8 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmem253Q3UNB8 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmem253Q3UNB8 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmem253Q3UNB8 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmem253Q3UNB8 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmem253Q3UNB8 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmem253Q3UNB8 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmem253Q3UNB8 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmem253Q3UNB8 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmem253Q3UNB8 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmem253Q3UNB8 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmem253Q3UNB8 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmem253Q3UNB8 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmem253Q3UNB8 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmem253Q3UNB8 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmem253Q3UNB8 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmem253Q3UNB8 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmem253Q3UNB8 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmem253Q3UNB8 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmem253Q3UNB8 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmem253Q3UNB8 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmem253Q3UNB8 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmem253Q3UNB8 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmem253Q3UNB8 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmem253Q3UNB8 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmem253Q3UNB8 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmem253Q3UNB8 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmem253Q3UNB8 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmem253Q3UNB8 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmem253Q3UNB8 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmem253Q3UNB8 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmem253Q3UNB8 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmem253Q3UNB8 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmem253Q3UNB8 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmem253Q3UNB8 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmem253Q3UNB8 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmem253Q3UNB8 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmem253Q3UNB8 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmem253Q3UNB8 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmem253Q3UNB8 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tmem253Q3UNB8 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tmem253Q3UNB8 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tmem253Q3UNB8 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tmem253Q3UNB8 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tmem253Q3UNB8 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tmem253Q3UNB8 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tmem253Q3UNB8 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tmem253Q3UNB8 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Tmem253Q3UNB8 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tmem253Q3UNB8 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tmem253Q3UNB8 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tmem253Q3UNB8 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tmem253Q3UNB8 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tmem253Q3UNB8 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tmem253Q3UNB8 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tmem253Q3UNB8 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tmem253Q3UNB8 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tmem253Q3UNB8 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tmem253Q3UNB8 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tmem253Q3UNB8 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tmem253Q3UNB8 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tmem253Q3UNB8 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmem253Q3UNB8 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmem253Q3UNB8 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmem253Q3UNB8 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmem253Q3UNB8 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmem253Q3UNB8 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmem253Q3UNB8 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmem253Q3UNB8 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmem253Q3UNB8 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmem253Q3UNB8 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmem253Q3UNB8 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmem253Q3UNB8 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmem253Q3UNB8 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmem253Q3UNB8 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmem253Q3UNB8 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmem253Q3UNB8 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmem253Q3UNB8 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmem253Q3UNB8 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmem253Q3UNB8 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmem253Q3UNB8 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tmem253Q3UNB8 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tmem253Q3UNB8 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tmem253Q3UNB8 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tmem253Q3UNB8 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tmem253Q3UNB8 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tmem253Q3UNB8 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tmem253Q3UNB8 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms