Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMU9

Hdgfl2, Hepatoma-derived growth factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl2Q3UMU9 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdgfl2Q3UMU9 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdgfl2Q3UMU9 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdgfl2Q3UMU9 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdgfl2Q3UMU9 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdgfl2Q3UMU9 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdgfl2Q3UMU9 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdgfl2Q3UMU9 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdgfl2Q3UMU9 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdgfl2Q3UMU9 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdgfl2Q3UMU9 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdgfl2Q3UMU9 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdgfl2Q3UMU9 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdgfl2Q3UMU9 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdgfl2Q3UMU9 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdgfl2Q3UMU9 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdgfl2Q3UMU9 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdgfl2Q3UMU9 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdgfl2Q3UMU9 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdgfl2Q3UMU9 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdgfl2Q3UMU9 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdgfl2Q3UMU9 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdgfl2Q3UMU9 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdgfl2Q3UMU9 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdgfl2Q3UMU9 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdgfl2Q3UMU9 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdgfl2Q3UMU9 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdgfl2Q3UMU9 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdgfl2Q3UMU9 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdgfl2Q3UMU9 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdgfl2Q3UMU9 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdgfl2Q3UMU9 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdgfl2Q3UMU9 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hdgfl2Q3UMU9 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hdgfl2Q3UMU9 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hdgfl2Q3UMU9 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hdgfl2Q3UMU9 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hdgfl2Q3UMU9 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hdgfl2Q3UMU9 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hdgfl2Q3UMU9 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Hdgfl2Q3UMU9 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hdgfl2Q3UMU9 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hdgfl2Q3UMU9 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hdgfl2Q3UMU9 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hdgfl2Q3UMU9 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hdgfl2Q3UMU9 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hdgfl2Q3UMU9 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hdgfl2Q3UMU9 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hdgfl2Q3UMU9 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hdgfl2Q3UMU9 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hdgfl2Q3UMU9 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hdgfl2Q3UMU9 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hdgfl2Q3UMU9 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hdgfl2Q3UMU9 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hdgfl2Q3UMU9 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hdgfl2Q3UMU9 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hdgfl2Q3UMU9 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hdgfl2Q3UMU9 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hdgfl2Q3UMU9 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hdgfl2Q3UMU9 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hdgfl2Q3UMU9 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hdgfl2Q3UMU9 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hdgfl2Q3UMU9 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hdgfl2Q3UMU9 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hdgfl2Q3UMU9 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hdgfl2Q3UMU9 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hdgfl2Q3UMU9 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hdgfl2Q3UMU9 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hdgfl2Q3UMU9 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hdgfl2Q3UMU9 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Hdgfl2Q3UMU9 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hdgfl2Q3UMU9 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hdgfl2Q3UMU9 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hdgfl2Q3UMU9 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hdgfl2Q3UMU9 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hdgfl2Q3UMU9 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hdgfl2Q3UMU9 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Hdgfl2Q3UMU9 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hdgfl2Q3UMU9 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hdgfl2Q3UMU9 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hdgfl2Q3UMU9 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hdgfl2Q3UMU9 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hdgfl2Q3UMU9 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hdgfl2Q3UMU9 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hdgfl2Q3UMU9 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hdgfl2Q3UMU9 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hdgfl2Q3UMU9 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hdgfl2Q3UMU9 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hdgfl2Q3UMU9 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdgfl2Q3UMU9 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdgfl2Q3UMU9 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdgfl2Q3UMU9 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdgfl2Q3UMU9 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdgfl2Q3UMU9 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdgfl2Q3UMU9 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdgfl2Q3UMU9 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdgfl2Q3UMU9 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdgfl2Q3UMU9 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdgfl2Q3UMU9 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hdgfl2Q3UMU9 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms