Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMG5

Lrch2, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrch2Q3UMG5 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrch2Q3UMG5 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrch2Q3UMG5 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrch2Q3UMG5 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrch2Q3UMG5 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrch2Q3UMG5 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrch2Q3UMG5 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrch2Q3UMG5 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrch2Q3UMG5 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrch2Q3UMG5 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrch2Q3UMG5 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrch2Q3UMG5 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrch2Q3UMG5 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrch2Q3UMG5 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrch2Q3UMG5 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrch2Q3UMG5 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lrch2Q3UMG5 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lrch2Q3UMG5 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lrch2Q3UMG5 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lrch2Q3UMG5 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lrch2Q3UMG5 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lrch2Q3UMG5 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lrch2Q3UMG5 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lrch2Q3UMG5 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Lrch2Q3UMG5 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lrch2Q3UMG5 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lrch2Q3UMG5 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lrch2Q3UMG5 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lrch2Q3UMG5 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lrch2Q3UMG5 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lrch2Q3UMG5 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lrch2Q3UMG5 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lrch2Q3UMG5 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lrch2Q3UMG5 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lrch2Q3UMG5 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lrch2Q3UMG5 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lrch2Q3UMG5 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lrch2Q3UMG5 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lrch2Q3UMG5 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lrch2Q3UMG5 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lrch2Q3UMG5 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lrch2Q3UMG5 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lrch2Q3UMG5 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lrch2Q3UMG5 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lrch2Q3UMG5 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lrch2Q3UMG5 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lrch2Q3UMG5 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lrch2Q3UMG5 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lrch2Q3UMG5 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Lrch2Q3UMG5 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lrch2Q3UMG5 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Lrch2Q3UMG5 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lrch2Q3UMG5 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lrch2Q3UMG5 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lrch2Q3UMG5 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lrch2Q3UMG5 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Lrch2Q3UMG5 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Lrch2Q3UMG5 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Lrch2Q3UMG5 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Lrch2Q3UMG5 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lrch2Q3UMG5 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lrch2Q3UMG5 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lrch2Q3UMG5 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lrch2Q3UMG5 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lrch2Q3UMG5 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lrch2Q3UMG5 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lrch2Q3UMG5 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lrch2Q3UMG5 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lrch2Q3UMG5 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lrch2Q3UMG5 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lrch2Q3UMG5 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lrch2Q3UMG5 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lrch2Q3UMG5 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lrch2Q3UMG5 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lrch2Q3UMG5 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lrch2Q3UMG5 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lrch2Q3UMG5 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lrch2Q3UMG5 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lrch2Q3UMG5 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lrch2Q3UMG5 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lrch2Q3UMG5 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lrch2Q3UMG5 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lrch2Q3UMG5 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lrch2Q3UMG5 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lrch2Q3UMG5 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lrch2Q3UMG5 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lrch2Q3UMG5 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lrch2Q3UMG5 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lrch2Q3UMG5 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lrch2Q3UMG5 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Lrch2Q3UMG5 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lrch2Q3UMG5 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Lrch2Q3UMG5 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lrch2Q3UMG5 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lrch2Q3UMG5 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lrch2Q3UMG5 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lrch2Q3UMG5 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lrch2Q3UMG5 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lrch2Q3UMG5 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lrch2Q3UMG5 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms