Protein–RNA interactions for Protein: Q3UM29

Cog7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog7Q3UM29 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cog7Q3UM29 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Cog7Q3UM29 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Cog7Q3UM29 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cog7Q3UM29 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cog7Q3UM29 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cog7Q3UM29 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cog7Q3UM29 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cog7Q3UM29 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cog7Q3UM29 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cog7Q3UM29 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cog7Q3UM29 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cog7Q3UM29 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cog7Q3UM29 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cog7Q3UM29 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cog7Q3UM29 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cog7Q3UM29 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cog7Q3UM29 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cog7Q3UM29 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cog7Q3UM29 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cog7Q3UM29 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cog7Q3UM29 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cog7Q3UM29 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cog7Q3UM29 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cog7Q3UM29 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cog7Q3UM29 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cog7Q3UM29 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cog7Q3UM29 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cog7Q3UM29 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cog7Q3UM29 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cog7Q3UM29 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Cog7Q3UM29 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cog7Q3UM29 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cog7Q3UM29 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cog7Q3UM29 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cog7Q3UM29 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cog7Q3UM29 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Cog7Q3UM29 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cog7Q3UM29 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cog7Q3UM29 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cog7Q3UM29 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cog7Q3UM29 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cog7Q3UM29 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cog7Q3UM29 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cog7Q3UM29 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cog7Q3UM29 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cog7Q3UM29 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cog7Q3UM29 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cog7Q3UM29 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cog7Q3UM29 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cog7Q3UM29 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cog7Q3UM29 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cog7Q3UM29 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cog7Q3UM29 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Cog7Q3UM29 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cog7Q3UM29 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cog7Q3UM29 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cog7Q3UM29 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cog7Q3UM29 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cog7Q3UM29 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cog7Q3UM29 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cog7Q3UM29 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cog7Q3UM29 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cog7Q3UM29 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cog7Q3UM29 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cog7Q3UM29 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cog7Q3UM29 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cog7Q3UM29 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cog7Q3UM29 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cog7Q3UM29 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cog7Q3UM29 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cog7Q3UM29 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cog7Q3UM29 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cog7Q3UM29 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cog7Q3UM29 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cog7Q3UM29 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cog7Q3UM29 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cog7Q3UM29 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cog7Q3UM29 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cog7Q3UM29 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cog7Q3UM29 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cog7Q3UM29 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cog7Q3UM29 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cog7Q3UM29 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cog7Q3UM29 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cog7Q3UM29 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cog7Q3UM29 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cog7Q3UM29 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cog7Q3UM29 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cog7Q3UM29 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cog7Q3UM29 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cog7Q3UM29 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cog7Q3UM29 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cog7Q3UM29 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cog7Q3UM29 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cog7Q3UM29 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cog7Q3UM29 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cog7Q3UM29 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cog7Q3UM29 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cog7Q3UM29 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms