Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW6

Ccdc33, Coiled-coil domain-containing protein 33, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc33Q3ULW6 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc33Q3ULW6 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc33Q3ULW6 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc33Q3ULW6 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc33Q3ULW6 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc33Q3ULW6 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc33Q3ULW6 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc33Q3ULW6 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc33Q3ULW6 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc33Q3ULW6 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc33Q3ULW6 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc33Q3ULW6 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc33Q3ULW6 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc33Q3ULW6 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc33Q3ULW6 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc33Q3ULW6 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc33Q3ULW6 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc33Q3ULW6 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc33Q3ULW6 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc33Q3ULW6 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc33Q3ULW6 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc33Q3ULW6 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc33Q3ULW6 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc33Q3ULW6 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc33Q3ULW6 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc33Q3ULW6 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc33Q3ULW6 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc33Q3ULW6 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc33Q3ULW6 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc33Q3ULW6 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc33Q3ULW6 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc33Q3ULW6 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc33Q3ULW6 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc33Q3ULW6 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc33Q3ULW6 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc33Q3ULW6 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc33Q3ULW6 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc33Q3ULW6 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc33Q3ULW6 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc33Q3ULW6 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc33Q3ULW6 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc33Q3ULW6 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc33Q3ULW6 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc33Q3ULW6 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc33Q3ULW6 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc33Q3ULW6 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc33Q3ULW6 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc33Q3ULW6 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc33Q3ULW6 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc33Q3ULW6 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc33Q3ULW6 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc33Q3ULW6 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc33Q3ULW6 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc33Q3ULW6 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccdc33Q3ULW6 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccdc33Q3ULW6 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccdc33Q3ULW6 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccdc33Q3ULW6 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc33Q3ULW6 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc33Q3ULW6 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc33Q3ULW6 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc33Q3ULW6 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc33Q3ULW6 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc33Q3ULW6 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc33Q3ULW6 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc33Q3ULW6 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc33Q3ULW6 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc33Q3ULW6 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc33Q3ULW6 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc33Q3ULW6 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc33Q3ULW6 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc33Q3ULW6 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc33Q3ULW6 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc33Q3ULW6 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc33Q3ULW6 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc33Q3ULW6 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc33Q3ULW6 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc33Q3ULW6 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc33Q3ULW6 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc33Q3ULW6 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc33Q3ULW6 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc33Q3ULW6 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc33Q3ULW6 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc33Q3ULW6 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc33Q3ULW6 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc33Q3ULW6 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc33Q3ULW6 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc33Q3ULW6 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc33Q3ULW6 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc33Q3ULW6 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc33Q3ULW6 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc33Q3ULW6 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc33Q3ULW6 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc33Q3ULW6 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc33Q3ULW6 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc33Q3ULW6 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc33Q3ULW6 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc33Q3ULW6 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc33Q3ULW6 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc33Q3ULW6 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms