Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULP7

Ctsll3, Cathepsin L-like 3, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctsll3Q3ULP7 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ctsll3Q3ULP7 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ctsll3Q3ULP7 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ctsll3Q3ULP7 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ctsll3Q3ULP7 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ctsll3Q3ULP7 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ctsll3Q3ULP7 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ctsll3Q3ULP7 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ctsll3Q3ULP7 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ctsll3Q3ULP7 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ctsll3Q3ULP7 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ctsll3Q3ULP7 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ctsll3Q3ULP7 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ctsll3Q3ULP7 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ctsll3Q3ULP7 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ctsll3Q3ULP7 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ctsll3Q3ULP7 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ctsll3Q3ULP7 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ctsll3Q3ULP7 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ctsll3Q3ULP7 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ctsll3Q3ULP7 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ctsll3Q3ULP7 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ctsll3Q3ULP7 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ctsll3Q3ULP7 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ctsll3Q3ULP7 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ctsll3Q3ULP7 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ctsll3Q3ULP7 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ctsll3Q3ULP7 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ctsll3Q3ULP7 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ctsll3Q3ULP7 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ctsll3Q3ULP7 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ctsll3Q3ULP7 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ctsll3Q3ULP7 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ctsll3Q3ULP7 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ctsll3Q3ULP7 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ctsll3Q3ULP7 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ctsll3Q3ULP7 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ctsll3Q3ULP7 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ctsll3Q3ULP7 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Ctsll3Q3ULP7 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ctsll3Q3ULP7 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ctsll3Q3ULP7 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ctsll3Q3ULP7 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ctsll3Q3ULP7 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ctsll3Q3ULP7 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ctsll3Q3ULP7 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ctsll3Q3ULP7 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ctsll3Q3ULP7 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ctsll3Q3ULP7 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ctsll3Q3ULP7 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Ctsll3Q3ULP7 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ctsll3Q3ULP7 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ctsll3Q3ULP7 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ctsll3Q3ULP7 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Ctsll3Q3ULP7 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ctsll3Q3ULP7 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ctsll3Q3ULP7 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Ctsll3Q3ULP7 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ctsll3Q3ULP7 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ctsll3Q3ULP7 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ctsll3Q3ULP7 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ctsll3Q3ULP7 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ctsll3Q3ULP7 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ctsll3Q3ULP7 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ctsll3Q3ULP7 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ctsll3Q3ULP7 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ctsll3Q3ULP7 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ctsll3Q3ULP7 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ctsll3Q3ULP7 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ctsll3Q3ULP7 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ctsll3Q3ULP7 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ctsll3Q3ULP7 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ctsll3Q3ULP7 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ctsll3Q3ULP7 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ctsll3Q3ULP7 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ctsll3Q3ULP7 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ctsll3Q3ULP7 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ctsll3Q3ULP7 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ctsll3Q3ULP7 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ctsll3Q3ULP7 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ctsll3Q3ULP7 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ctsll3Q3ULP7 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ctsll3Q3ULP7 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ctsll3Q3ULP7 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ctsll3Q3ULP7 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ctsll3Q3ULP7 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ctsll3Q3ULP7 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ctsll3Q3ULP7 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ctsll3Q3ULP7 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ctsll3Q3ULP7 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ctsll3Q3ULP7 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ctsll3Q3ULP7 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ctsll3Q3ULP7 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ctsll3Q3ULP7 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ctsll3Q3ULP7 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ctsll3Q3ULP7 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ctsll3Q3ULP7 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ctsll3Q3ULP7 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ctsll3Q3ULP7 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ctsll3Q3ULP7 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms