Protein–RNA interactions for Protein: Q3UKJ7

Smu1, WD40 repeat-containing protein SMU1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smu1Q3UKJ7 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smu1Q3UKJ7 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smu1Q3UKJ7 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smu1Q3UKJ7 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smu1Q3UKJ7 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smu1Q3UKJ7 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smu1Q3UKJ7 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smu1Q3UKJ7 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smu1Q3UKJ7 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smu1Q3UKJ7 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smu1Q3UKJ7 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smu1Q3UKJ7 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smu1Q3UKJ7 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smu1Q3UKJ7 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smu1Q3UKJ7 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smu1Q3UKJ7 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smu1Q3UKJ7 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smu1Q3UKJ7 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smu1Q3UKJ7 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smu1Q3UKJ7 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smu1Q3UKJ7 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smu1Q3UKJ7 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smu1Q3UKJ7 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smu1Q3UKJ7 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smu1Q3UKJ7 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smu1Q3UKJ7 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smu1Q3UKJ7 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smu1Q3UKJ7 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smu1Q3UKJ7 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smu1Q3UKJ7 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smu1Q3UKJ7 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smu1Q3UKJ7 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smu1Q3UKJ7 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smu1Q3UKJ7 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smu1Q3UKJ7 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smu1Q3UKJ7 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smu1Q3UKJ7 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smu1Q3UKJ7 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smu1Q3UKJ7 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smu1Q3UKJ7 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smu1Q3UKJ7 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smu1Q3UKJ7 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smu1Q3UKJ7 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smu1Q3UKJ7 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smu1Q3UKJ7 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smu1Q3UKJ7 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smu1Q3UKJ7 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smu1Q3UKJ7 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smu1Q3UKJ7 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smu1Q3UKJ7 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smu1Q3UKJ7 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Smu1Q3UKJ7 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smu1Q3UKJ7 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smu1Q3UKJ7 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smu1Q3UKJ7 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smu1Q3UKJ7 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smu1Q3UKJ7 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smu1Q3UKJ7 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smu1Q3UKJ7 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smu1Q3UKJ7 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smu1Q3UKJ7 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smu1Q3UKJ7 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smu1Q3UKJ7 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smu1Q3UKJ7 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smu1Q3UKJ7 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smu1Q3UKJ7 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smu1Q3UKJ7 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smu1Q3UKJ7 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smu1Q3UKJ7 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smu1Q3UKJ7 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Smu1Q3UKJ7 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Smu1Q3UKJ7 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Smu1Q3UKJ7 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Smu1Q3UKJ7 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smu1Q3UKJ7 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smu1Q3UKJ7 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smu1Q3UKJ7 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smu1Q3UKJ7 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Smu1Q3UKJ7 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smu1Q3UKJ7 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smu1Q3UKJ7 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smu1Q3UKJ7 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smu1Q3UKJ7 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smu1Q3UKJ7 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smu1Q3UKJ7 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smu1Q3UKJ7 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smu1Q3UKJ7 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smu1Q3UKJ7 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smu1Q3UKJ7 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smu1Q3UKJ7 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smu1Q3UKJ7 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smu1Q3UKJ7 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smu1Q3UKJ7 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smu1Q3UKJ7 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smu1Q3UKJ7 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smu1Q3UKJ7 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smu1Q3UKJ7 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smu1Q3UKJ7 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smu1Q3UKJ7 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smu1Q3UKJ7 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms