Protein–RNA interactions for Protein: Q3UK78

Pcgf5, Polycomb group RING finger protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcgf5Q3UK78 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcgf5Q3UK78 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcgf5Q3UK78 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcgf5Q3UK78 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcgf5Q3UK78 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcgf5Q3UK78 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcgf5Q3UK78 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcgf5Q3UK78 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcgf5Q3UK78 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcgf5Q3UK78 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcgf5Q3UK78 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcgf5Q3UK78 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcgf5Q3UK78 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcgf5Q3UK78 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcgf5Q3UK78 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcgf5Q3UK78 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcgf5Q3UK78 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcgf5Q3UK78 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcgf5Q3UK78 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcgf5Q3UK78 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcgf5Q3UK78 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcgf5Q3UK78 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcgf5Q3UK78 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcgf5Q3UK78 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcgf5Q3UK78 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pcgf5Q3UK78 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Pcgf5Q3UK78 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Pcgf5Q3UK78 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pcgf5Q3UK78 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pcgf5Q3UK78 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pcgf5Q3UK78 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pcgf5Q3UK78 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pcgf5Q3UK78 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pcgf5Q3UK78 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pcgf5Q3UK78 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pcgf5Q3UK78 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Pcgf5Q3UK78 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pcgf5Q3UK78 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Pcgf5Q3UK78 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pcgf5Q3UK78 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pcgf5Q3UK78 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pcgf5Q3UK78 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pcgf5Q3UK78 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pcgf5Q3UK78 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pcgf5Q3UK78 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pcgf5Q3UK78 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pcgf5Q3UK78 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pcgf5Q3UK78 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pcgf5Q3UK78 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pcgf5Q3UK78 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pcgf5Q3UK78 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pcgf5Q3UK78 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pcgf5Q3UK78 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pcgf5Q3UK78 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pcgf5Q3UK78 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pcgf5Q3UK78 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pcgf5Q3UK78 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pcgf5Q3UK78 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pcgf5Q3UK78 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pcgf5Q3UK78 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pcgf5Q3UK78 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Pcgf5Q3UK78 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pcgf5Q3UK78 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pcgf5Q3UK78 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pcgf5Q3UK78 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pcgf5Q3UK78 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pcgf5Q3UK78 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pcgf5Q3UK78 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcgf5Q3UK78 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcgf5Q3UK78 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcgf5Q3UK78 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcgf5Q3UK78 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcgf5Q3UK78 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcgf5Q3UK78 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcgf5Q3UK78 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcgf5Q3UK78 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcgf5Q3UK78 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcgf5Q3UK78 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcgf5Q3UK78 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcgf5Q3UK78 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcgf5Q3UK78 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcgf5Q3UK78 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcgf5Q3UK78 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcgf5Q3UK78 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcgf5Q3UK78 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcgf5Q3UK78 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcgf5Q3UK78 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcgf5Q3UK78 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcgf5Q3UK78 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcgf5Q3UK78 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcgf5Q3UK78 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcgf5Q3UK78 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcgf5Q3UK78 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcgf5Q3UK78 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcgf5Q3UK78 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcgf5Q3UK78 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcgf5Q3UK78 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pcgf5Q3UK78 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pcgf5Q3UK78 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pcgf5Q3UK78 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms