Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Usp19Q3UJD6 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Usp19Q3UJD6 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Usp19Q3UJD6 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Usp19Q3UJD6 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Usp19Q3UJD6 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Usp19Q3UJD6 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Usp19Q3UJD6 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Usp19Q3UJD6 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Usp19Q3UJD6 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Usp19Q3UJD6 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Usp19Q3UJD6 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Usp19Q3UJD6 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Usp19Q3UJD6 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Usp19Q3UJD6 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Usp19Q3UJD6 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Usp19Q3UJD6 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Usp19Q3UJD6 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Usp19Q3UJD6 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Usp19Q3UJD6 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Usp19Q3UJD6 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Usp19Q3UJD6 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Usp19Q3UJD6 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Usp19Q3UJD6 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Usp19Q3UJD6 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Usp19Q3UJD6 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Usp19Q3UJD6 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Usp19Q3UJD6 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Usp19Q3UJD6 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Usp19Q3UJD6 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Usp19Q3UJD6 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Usp19Q3UJD6 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Usp19Q3UJD6 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Usp19Q3UJD6 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Usp19Q3UJD6 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Usp19Q3UJD6 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Usp19Q3UJD6 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Usp19Q3UJD6 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Usp19Q3UJD6 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Usp19Q3UJD6 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Usp19Q3UJD6 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Usp19Q3UJD6 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Usp19Q3UJD6 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Usp19Q3UJD6 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Usp19Q3UJD6 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Usp19Q3UJD6 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Usp19Q3UJD6 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Usp19Q3UJD6 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Usp19Q3UJD6 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Usp19Q3UJD6 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Usp19Q3UJD6 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Usp19Q3UJD6 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Usp19Q3UJD6 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Usp19Q3UJD6 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Usp19Q3UJD6 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Usp19Q3UJD6 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Usp19Q3UJD6 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Usp19Q3UJD6 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Usp19Q3UJD6 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Usp19Q3UJD6 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Usp19Q3UJD6 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Usp19Q3UJD6 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Usp19Q3UJD6 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Usp19Q3UJD6 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Usp19Q3UJD6 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Usp19Q3UJD6 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Usp19Q3UJD6 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Usp19Q3UJD6 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Usp19Q3UJD6 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Usp19Q3UJD6 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Usp19Q3UJD6 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Usp19Q3UJD6 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Usp19Q3UJD6 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Usp19Q3UJD6 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Usp19Q3UJD6 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Usp19Q3UJD6 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Usp19Q3UJD6 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Usp19Q3UJD6 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Usp19Q3UJD6 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Usp19Q3UJD6 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Usp19Q3UJD6 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Usp19Q3UJD6 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Usp19Q3UJD6 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Usp19Q3UJD6 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Usp19Q3UJD6 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Usp19Q3UJD6 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Usp19Q3UJD6 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Usp19Q3UJD6 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Usp19Q3UJD6 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Usp19Q3UJD6 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Usp19Q3UJD6 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Usp19Q3UJD6 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Usp19Q3UJD6 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Usp19Q3UJD6 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Usp19Q3UJD6 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Usp19Q3UJD6 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Usp19Q3UJD6 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Usp19Q3UJD6 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Usp19Q3UJD6 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Usp19Q3UJD6 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms