Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB9

Edc4, Enhancer of mRNA-decapping protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edc4Q3UJB9 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Edc4Q3UJB9 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Edc4Q3UJB9 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Edc4Q3UJB9 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Edc4Q3UJB9 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Edc4Q3UJB9 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Edc4Q3UJB9 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Edc4Q3UJB9 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Edc4Q3UJB9 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Edc4Q3UJB9 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Edc4Q3UJB9 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Edc4Q3UJB9 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Edc4Q3UJB9 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Edc4Q3UJB9 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Edc4Q3UJB9 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Edc4Q3UJB9 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Edc4Q3UJB9 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Edc4Q3UJB9 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Edc4Q3UJB9 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Edc4Q3UJB9 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Edc4Q3UJB9 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Edc4Q3UJB9 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Edc4Q3UJB9 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Edc4Q3UJB9 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Edc4Q3UJB9 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Edc4Q3UJB9 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Edc4Q3UJB9 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Edc4Q3UJB9 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Edc4Q3UJB9 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Edc4Q3UJB9 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Edc4Q3UJB9 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Edc4Q3UJB9 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Edc4Q3UJB9 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Edc4Q3UJB9 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Edc4Q3UJB9 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Edc4Q3UJB9 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Edc4Q3UJB9 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Edc4Q3UJB9 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Edc4Q3UJB9 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Edc4Q3UJB9 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Edc4Q3UJB9 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Edc4Q3UJB9 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Edc4Q3UJB9 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Edc4Q3UJB9 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Edc4Q3UJB9 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Edc4Q3UJB9 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Edc4Q3UJB9 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Edc4Q3UJB9 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Edc4Q3UJB9 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Edc4Q3UJB9 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Edc4Q3UJB9 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Edc4Q3UJB9 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Edc4Q3UJB9 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Edc4Q3UJB9 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Edc4Q3UJB9 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Edc4Q3UJB9 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Edc4Q3UJB9 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Edc4Q3UJB9 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Edc4Q3UJB9 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Edc4Q3UJB9 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Edc4Q3UJB9 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Edc4Q3UJB9 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Edc4Q3UJB9 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Edc4Q3UJB9 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Edc4Q3UJB9 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Edc4Q3UJB9 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Edc4Q3UJB9 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Edc4Q3UJB9 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Edc4Q3UJB9 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Edc4Q3UJB9 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Edc4Q3UJB9 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Edc4Q3UJB9 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Edc4Q3UJB9 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Edc4Q3UJB9 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Edc4Q3UJB9 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Edc4Q3UJB9 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Edc4Q3UJB9 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Edc4Q3UJB9 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Edc4Q3UJB9 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Edc4Q3UJB9 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Edc4Q3UJB9 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Edc4Q3UJB9 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Edc4Q3UJB9 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Edc4Q3UJB9 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Edc4Q3UJB9 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Edc4Q3UJB9 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Edc4Q3UJB9 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Edc4Q3UJB9 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Edc4Q3UJB9 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Edc4Q3UJB9 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Edc4Q3UJB9 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Edc4Q3UJB9 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Edc4Q3UJB9 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Edc4Q3UJB9 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Edc4Q3UJB9 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Edc4Q3UJB9 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Edc4Q3UJB9 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Edc4Q3UJB9 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Edc4Q3UJB9 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Edc4Q3UJB9 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms