Protein–RNA interactions for Protein: Q3UIW8

Rnf224, RING finger protein 224, mousemouse

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf224Q3UIW8 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf224Q3UIW8 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf224Q3UIW8 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf224Q3UIW8 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf224Q3UIW8 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf224Q3UIW8 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf224Q3UIW8 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf224Q3UIW8 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf224Q3UIW8 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf224Q3UIW8 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf224Q3UIW8 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf224Q3UIW8 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf224Q3UIW8 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf224Q3UIW8 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf224Q3UIW8 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf224Q3UIW8 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf224Q3UIW8 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf224Q3UIW8 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf224Q3UIW8 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf224Q3UIW8 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.02
Rnf224Q3UIW8 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf224Q3UIW8 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf224Q3UIW8 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf224Q3UIW8 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf224Q3UIW8 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf224Q3UIW8 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf224Q3UIW8 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf224Q3UIW8 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf224Q3UIW8 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf224Q3UIW8 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf224Q3UIW8 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf224Q3UIW8 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf224Q3UIW8 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf224Q3UIW8 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf224Q3UIW8 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf224Q3UIW8 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf224Q3UIW8 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf224Q3UIW8 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf224Q3UIW8 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf224Q3UIW8 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf224Q3UIW8 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf224Q3UIW8 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf224Q3UIW8 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf224Q3UIW8 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf224Q3UIW8 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf224Q3UIW8 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf224Q3UIW8 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf224Q3UIW8 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf224Q3UIW8 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf224Q3UIW8 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf224Q3UIW8 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf224Q3UIW8 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf224Q3UIW8 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf224Q3UIW8 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf224Q3UIW8 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf224Q3UIW8 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf224Q3UIW8 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf224Q3UIW8 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf224Q3UIW8 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf224Q3UIW8 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf224Q3UIW8 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf224Q3UIW8 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf224Q3UIW8 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf224Q3UIW8 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf224Q3UIW8 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf224Q3UIW8 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf224Q3UIW8 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf224Q3UIW8 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf224Q3UIW8 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf224Q3UIW8 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf224Q3UIW8 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf224Q3UIW8 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf224Q3UIW8 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf224Q3UIW8 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf224Q3UIW8 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf224Q3UIW8 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf224Q3UIW8 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf224Q3UIW8 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf224Q3UIW8 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf224Q3UIW8 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf224Q3UIW8 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf224Q3UIW8 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf224Q3UIW8 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnf224Q3UIW8 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnf224Q3UIW8 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnf224Q3UIW8 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnf224Q3UIW8 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnf224Q3UIW8 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnf224Q3UIW8 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnf224Q3UIW8 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnf224Q3UIW8 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnf224Q3UIW8 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnf224Q3UIW8 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnf224Q3UIW8 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnf224Q3UIW8 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnf224Q3UIW8 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnf224Q3UIW8 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnf224Q3UIW8 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnf224Q3UIW8 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnf224Q3UIW8 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
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