Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHZ5

Lmod2, Leiomodin-2, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod2Q3UHZ5 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lmod2Q3UHZ5 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lmod2Q3UHZ5 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lmod2Q3UHZ5 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lmod2Q3UHZ5 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Lmod2Q3UHZ5 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Lmod2Q3UHZ5 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lmod2Q3UHZ5 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lmod2Q3UHZ5 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lmod2Q3UHZ5 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lmod2Q3UHZ5 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lmod2Q3UHZ5 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lmod2Q3UHZ5 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lmod2Q3UHZ5 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lmod2Q3UHZ5 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lmod2Q3UHZ5 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lmod2Q3UHZ5 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lmod2Q3UHZ5 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lmod2Q3UHZ5 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lmod2Q3UHZ5 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Lmod2Q3UHZ5 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lmod2Q3UHZ5 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lmod2Q3UHZ5 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lmod2Q3UHZ5 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lmod2Q3UHZ5 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lmod2Q3UHZ5 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Lmod2Q3UHZ5 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Lmod2Q3UHZ5 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lmod2Q3UHZ5 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lmod2Q3UHZ5 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lmod2Q3UHZ5 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lmod2Q3UHZ5 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lmod2Q3UHZ5 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lmod2Q3UHZ5 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lmod2Q3UHZ5 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lmod2Q3UHZ5 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lmod2Q3UHZ5 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lmod2Q3UHZ5 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lmod2Q3UHZ5 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lmod2Q3UHZ5 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lmod2Q3UHZ5 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lmod2Q3UHZ5 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lmod2Q3UHZ5 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Lmod2Q3UHZ5 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lmod2Q3UHZ5 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lmod2Q3UHZ5 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lmod2Q3UHZ5 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lmod2Q3UHZ5 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Lmod2Q3UHZ5 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Lmod2Q3UHZ5 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Lmod2Q3UHZ5 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Lmod2Q3UHZ5 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Lmod2Q3UHZ5 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Lmod2Q3UHZ5 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Lmod2Q3UHZ5 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Lmod2Q3UHZ5 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Lmod2Q3UHZ5 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Lmod2Q3UHZ5 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Lmod2Q3UHZ5 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Lmod2Q3UHZ5 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Lmod2Q3UHZ5 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Lmod2Q3UHZ5 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Lmod2Q3UHZ5 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Lmod2Q3UHZ5 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Lmod2Q3UHZ5 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Lmod2Q3UHZ5 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Lmod2Q3UHZ5 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lmod2Q3UHZ5 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lmod2Q3UHZ5 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lmod2Q3UHZ5 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lmod2Q3UHZ5 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lmod2Q3UHZ5 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lmod2Q3UHZ5 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lmod2Q3UHZ5 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Lmod2Q3UHZ5 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lmod2Q3UHZ5 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Lmod2Q3UHZ5 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lmod2Q3UHZ5 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lmod2Q3UHZ5 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lmod2Q3UHZ5 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lmod2Q3UHZ5 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lmod2Q3UHZ5 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lmod2Q3UHZ5 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lmod2Q3UHZ5 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lmod2Q3UHZ5 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Lmod2Q3UHZ5 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lmod2Q3UHZ5 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lmod2Q3UHZ5 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lmod2Q3UHZ5 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lmod2Q3UHZ5 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lmod2Q3UHZ5 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lmod2Q3UHZ5 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lmod2Q3UHZ5 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lmod2Q3UHZ5 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lmod2Q3UHZ5 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lmod2Q3UHZ5 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lmod2Q3UHZ5 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lmod2Q3UHZ5 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lmod2Q3UHZ5 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lmod2Q3UHZ5 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.1 ms