Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGP9

Lrrc58, Leucine-rich repeat-containing protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc58Q3UGP9 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrc58Q3UGP9 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrc58Q3UGP9 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrc58Q3UGP9 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrc58Q3UGP9 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrc58Q3UGP9 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lrrc58Q3UGP9 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lrrc58Q3UGP9 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc58Q3UGP9 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc58Q3UGP9 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc58Q3UGP9 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc58Q3UGP9 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc58Q3UGP9 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc58Q3UGP9 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc58Q3UGP9 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc58Q3UGP9 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc58Q3UGP9 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc58Q3UGP9 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc58Q3UGP9 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc58Q3UGP9 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc58Q3UGP9 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc58Q3UGP9 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc58Q3UGP9 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc58Q3UGP9 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc58Q3UGP9 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc58Q3UGP9 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc58Q3UGP9 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc58Q3UGP9 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc58Q3UGP9 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc58Q3UGP9 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc58Q3UGP9 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc58Q3UGP9 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc58Q3UGP9 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc58Q3UGP9 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc58Q3UGP9 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc58Q3UGP9 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc58Q3UGP9 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc58Q3UGP9 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc58Q3UGP9 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc58Q3UGP9 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lrrc58Q3UGP9 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc58Q3UGP9 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc58Q3UGP9 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc58Q3UGP9 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc58Q3UGP9 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc58Q3UGP9 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc58Q3UGP9 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc58Q3UGP9 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc58Q3UGP9 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc58Q3UGP9 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc58Q3UGP9 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc58Q3UGP9 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc58Q3UGP9 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc58Q3UGP9 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc58Q3UGP9 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc58Q3UGP9 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc58Q3UGP9 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc58Q3UGP9 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc58Q3UGP9 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc58Q3UGP9 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc58Q3UGP9 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc58Q3UGP9 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc58Q3UGP9 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrc58Q3UGP9 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrc58Q3UGP9 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrc58Q3UGP9 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrc58Q3UGP9 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrc58Q3UGP9 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrc58Q3UGP9 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrc58Q3UGP9 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrc58Q3UGP9 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrc58Q3UGP9 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrc58Q3UGP9 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrc58Q3UGP9 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrc58Q3UGP9 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrc58Q3UGP9 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrc58Q3UGP9 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrc58Q3UGP9 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrc58Q3UGP9 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrc58Q3UGP9 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrc58Q3UGP9 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrc58Q3UGP9 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrc58Q3UGP9 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrc58Q3UGP9 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrc58Q3UGP9 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrc58Q3UGP9 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrc58Q3UGP9 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrc58Q3UGP9 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrc58Q3UGP9 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrc58Q3UGP9 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrc58Q3UGP9 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrc58Q3UGP9 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrc58Q3UGP9 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrc58Q3UGP9 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrc58Q3UGP9 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrc58Q3UGP9 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrc58Q3UGP9 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrc58Q3UGP9 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrc58Q3UGP9 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrc58Q3UGP9 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms