Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFM5

Nom1, Nucleolar MIF4G domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 854 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nom1Q3UFM5 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nom1Q3UFM5 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nom1Q3UFM5 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Nom1Q3UFM5 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nom1Q3UFM5 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nom1Q3UFM5 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nom1Q3UFM5 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nom1Q3UFM5 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nom1Q3UFM5 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nom1Q3UFM5 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nom1Q3UFM5 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nom1Q3UFM5 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nom1Q3UFM5 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nom1Q3UFM5 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nom1Q3UFM5 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nom1Q3UFM5 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Nom1Q3UFM5 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nom1Q3UFM5 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nom1Q3UFM5 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nom1Q3UFM5 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nom1Q3UFM5 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nom1Q3UFM5 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nom1Q3UFM5 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nom1Q3UFM5 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nom1Q3UFM5 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nom1Q3UFM5 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nom1Q3UFM5 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nom1Q3UFM5 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nom1Q3UFM5 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nom1Q3UFM5 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nom1Q3UFM5 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nom1Q3UFM5 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nom1Q3UFM5 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nom1Q3UFM5 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nom1Q3UFM5 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nom1Q3UFM5 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nom1Q3UFM5 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nom1Q3UFM5 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nom1Q3UFM5 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nom1Q3UFM5 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nom1Q3UFM5 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nom1Q3UFM5 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Nom1Q3UFM5 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nom1Q3UFM5 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nom1Q3UFM5 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nom1Q3UFM5 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nom1Q3UFM5 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nom1Q3UFM5 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nom1Q3UFM5 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nom1Q3UFM5 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nom1Q3UFM5 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nom1Q3UFM5 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nom1Q3UFM5 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nom1Q3UFM5 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nom1Q3UFM5 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nom1Q3UFM5 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nom1Q3UFM5 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nom1Q3UFM5 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nom1Q3UFM5 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nom1Q3UFM5 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nom1Q3UFM5 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nom1Q3UFM5 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nom1Q3UFM5 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Nom1Q3UFM5 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nom1Q3UFM5 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nom1Q3UFM5 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nom1Q3UFM5 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nom1Q3UFM5 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nom1Q3UFM5 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nom1Q3UFM5 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nom1Q3UFM5 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nom1Q3UFM5 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nom1Q3UFM5 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nom1Q3UFM5 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nom1Q3UFM5 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nom1Q3UFM5 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nom1Q3UFM5 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nom1Q3UFM5 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nom1Q3UFM5 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nom1Q3UFM5 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nom1Q3UFM5 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nom1Q3UFM5 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nom1Q3UFM5 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nom1Q3UFM5 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nom1Q3UFM5 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nom1Q3UFM5 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nom1Q3UFM5 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nom1Q3UFM5 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nom1Q3UFM5 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nom1Q3UFM5 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nom1Q3UFM5 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nom1Q3UFM5 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nom1Q3UFM5 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Nom1Q3UFM5 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nom1Q3UFM5 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nom1Q3UFM5 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nom1Q3UFM5 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nom1Q3UFM5 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nom1Q3UFM5 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nom1Q3UFM5 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms