Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEB3

Puf60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Puf60Q3UEB3 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Puf60Q3UEB3 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Puf60Q3UEB3 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Puf60Q3UEB3 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Puf60Q3UEB3 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Puf60Q3UEB3 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Puf60Q3UEB3 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Puf60Q3UEB3 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Puf60Q3UEB3 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Puf60Q3UEB3 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Puf60Q3UEB3 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Puf60Q3UEB3 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Puf60Q3UEB3 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Puf60Q3UEB3 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Puf60Q3UEB3 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Puf60Q3UEB3 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Puf60Q3UEB3 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Puf60Q3UEB3 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Puf60Q3UEB3 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Puf60Q3UEB3 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Puf60Q3UEB3 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Puf60Q3UEB3 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Puf60Q3UEB3 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Puf60Q3UEB3 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Puf60Q3UEB3 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Puf60Q3UEB3 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Puf60Q3UEB3 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Puf60Q3UEB3 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Puf60Q3UEB3 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Puf60Q3UEB3 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Puf60Q3UEB3 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Puf60Q3UEB3 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Puf60Q3UEB3 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Puf60Q3UEB3 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Puf60Q3UEB3 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Puf60Q3UEB3 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Puf60Q3UEB3 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Puf60Q3UEB3 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Puf60Q3UEB3 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Puf60Q3UEB3 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Puf60Q3UEB3 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Puf60Q3UEB3 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Puf60Q3UEB3 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Puf60Q3UEB3 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Puf60Q3UEB3 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Puf60Q3UEB3 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Puf60Q3UEB3 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Puf60Q3UEB3 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Puf60Q3UEB3 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Puf60Q3UEB3 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Puf60Q3UEB3 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Puf60Q3UEB3 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Puf60Q3UEB3 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Puf60Q3UEB3 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Puf60Q3UEB3 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Puf60Q3UEB3 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Puf60Q3UEB3 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Puf60Q3UEB3 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Puf60Q3UEB3 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Puf60Q3UEB3 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Puf60Q3UEB3 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Puf60Q3UEB3 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Puf60Q3UEB3 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Puf60Q3UEB3 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Puf60Q3UEB3 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Puf60Q3UEB3 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Puf60Q3UEB3 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Puf60Q3UEB3 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Puf60Q3UEB3 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Puf60Q3UEB3 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Puf60Q3UEB3 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Puf60Q3UEB3 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Puf60Q3UEB3 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Puf60Q3UEB3 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Puf60Q3UEB3 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Puf60Q3UEB3 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Puf60Q3UEB3 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Puf60Q3UEB3 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Puf60Q3UEB3 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Puf60Q3UEB3 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Puf60Q3UEB3 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Puf60Q3UEB3 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Puf60Q3UEB3 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Puf60Q3UEB3 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Puf60Q3UEB3 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Puf60Q3UEB3 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Puf60Q3UEB3 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Puf60Q3UEB3 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Puf60Q3UEB3 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Puf60Q3UEB3 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Puf60Q3UEB3 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Puf60Q3UEB3 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Puf60Q3UEB3 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Puf60Q3UEB3 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Puf60Q3UEB3 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Puf60Q3UEB3 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Puf60Q3UEB3 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Puf60Q3UEB3 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Puf60Q3UEB3 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Puf60Q3UEB3 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms