Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trafd1Q3UDK1 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trafd1Q3UDK1 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trafd1Q3UDK1 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trafd1Q3UDK1 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trafd1Q3UDK1 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Trafd1Q3UDK1 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trafd1Q3UDK1 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Trafd1Q3UDK1 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trafd1Q3UDK1 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trafd1Q3UDK1 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trafd1Q3UDK1 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trafd1Q3UDK1 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trafd1Q3UDK1 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Trafd1Q3UDK1 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trafd1Q3UDK1 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trafd1Q3UDK1 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trafd1Q3UDK1 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trafd1Q3UDK1 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trafd1Q3UDK1 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trafd1Q3UDK1 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trafd1Q3UDK1 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trafd1Q3UDK1 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trafd1Q3UDK1 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trafd1Q3UDK1 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trafd1Q3UDK1 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trafd1Q3UDK1 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trafd1Q3UDK1 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trafd1Q3UDK1 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trafd1Q3UDK1 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trafd1Q3UDK1 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trafd1Q3UDK1 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trafd1Q3UDK1 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trafd1Q3UDK1 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trafd1Q3UDK1 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trafd1Q3UDK1 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trafd1Q3UDK1 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trafd1Q3UDK1 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Trafd1Q3UDK1 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trafd1Q3UDK1 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trafd1Q3UDK1 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trafd1Q3UDK1 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trafd1Q3UDK1 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trafd1Q3UDK1 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trafd1Q3UDK1 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trafd1Q3UDK1 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trafd1Q3UDK1 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trafd1Q3UDK1 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trafd1Q3UDK1 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trafd1Q3UDK1 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trafd1Q3UDK1 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trafd1Q3UDK1 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trafd1Q3UDK1 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trafd1Q3UDK1 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trafd1Q3UDK1 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trafd1Q3UDK1 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trafd1Q3UDK1 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trafd1Q3UDK1 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trafd1Q3UDK1 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trafd1Q3UDK1 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trafd1Q3UDK1 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trafd1Q3UDK1 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trafd1Q3UDK1 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Trafd1Q3UDK1 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trafd1Q3UDK1 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trafd1Q3UDK1 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trafd1Q3UDK1 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trafd1Q3UDK1 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trafd1Q3UDK1 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trafd1Q3UDK1 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trafd1Q3UDK1 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trafd1Q3UDK1 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trafd1Q3UDK1 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trafd1Q3UDK1 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trafd1Q3UDK1 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trafd1Q3UDK1 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trafd1Q3UDK1 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trafd1Q3UDK1 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trafd1Q3UDK1 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trafd1Q3UDK1 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trafd1Q3UDK1 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trafd1Q3UDK1 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trafd1Q3UDK1 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trafd1Q3UDK1 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trafd1Q3UDK1 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Trafd1Q3UDK1 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trafd1Q3UDK1 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trafd1Q3UDK1 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trafd1Q3UDK1 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trafd1Q3UDK1 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trafd1Q3UDK1 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trafd1Q3UDK1 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trafd1Q3UDK1 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trafd1Q3UDK1 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trafd1Q3UDK1 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trafd1Q3UDK1 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trafd1Q3UDK1 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Trafd1Q3UDK1 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trafd1Q3UDK1 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trafd1Q3UDK1 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms