Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDE2

Ttll12, Tubulin--tyrosine ligase-like protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll12Q3UDE2 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ttll12Q3UDE2 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ttll12Q3UDE2 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Ttll12Q3UDE2 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ttll12Q3UDE2 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ttll12Q3UDE2 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ttll12Q3UDE2 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ttll12Q3UDE2 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ttll12Q3UDE2 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ttll12Q3UDE2 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ttll12Q3UDE2 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ttll12Q3UDE2 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ttll12Q3UDE2 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ttll12Q3UDE2 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ttll12Q3UDE2 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ttll12Q3UDE2 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ttll12Q3UDE2 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ttll12Q3UDE2 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ttll12Q3UDE2 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ttll12Q3UDE2 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ttll12Q3UDE2 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ttll12Q3UDE2 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ttll12Q3UDE2 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ttll12Q3UDE2 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ttll12Q3UDE2 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ttll12Q3UDE2 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ttll12Q3UDE2 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ttll12Q3UDE2 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Ttll12Q3UDE2 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Ttll12Q3UDE2 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ttll12Q3UDE2 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ttll12Q3UDE2 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ttll12Q3UDE2 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ttll12Q3UDE2 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ttll12Q3UDE2 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ttll12Q3UDE2 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Ttll12Q3UDE2 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ttll12Q3UDE2 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ttll12Q3UDE2 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ttll12Q3UDE2 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ttll12Q3UDE2 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ttll12Q3UDE2 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ttll12Q3UDE2 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ttll12Q3UDE2 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ttll12Q3UDE2 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ttll12Q3UDE2 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ttll12Q3UDE2 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ttll12Q3UDE2 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ttll12Q3UDE2 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ttll12Q3UDE2 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ttll12Q3UDE2 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ttll12Q3UDE2 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ttll12Q3UDE2 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ttll12Q3UDE2 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ttll12Q3UDE2 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ttll12Q3UDE2 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ttll12Q3UDE2 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ttll12Q3UDE2 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ttll12Q3UDE2 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ttll12Q3UDE2 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ttll12Q3UDE2 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ttll12Q3UDE2 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ttll12Q3UDE2 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ttll12Q3UDE2 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ttll12Q3UDE2 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ttll12Q3UDE2 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ttll12Q3UDE2 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ttll12Q3UDE2 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Ttll12Q3UDE2 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ttll12Q3UDE2 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ttll12Q3UDE2 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ttll12Q3UDE2 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ttll12Q3UDE2 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ttll12Q3UDE2 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ttll12Q3UDE2 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ttll12Q3UDE2 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ttll12Q3UDE2 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ttll12Q3UDE2 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ttll12Q3UDE2 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ttll12Q3UDE2 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ttll12Q3UDE2 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ttll12Q3UDE2 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ttll12Q3UDE2 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ttll12Q3UDE2 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ttll12Q3UDE2 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ttll12Q3UDE2 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Ttll12Q3UDE2 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ttll12Q3UDE2 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ttll12Q3UDE2 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ttll12Q3UDE2 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ttll12Q3UDE2 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ttll12Q3UDE2 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Ttll12Q3UDE2 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Ttll12Q3UDE2 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ttll12Q3UDE2 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ttll12Q3UDE2 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ttll12Q3UDE2 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ttll12Q3UDE2 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ttll12Q3UDE2 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ttll12Q3UDE2 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms