Protein–RNA interactions for Protein: Q3UD01

Atxn7l3b, Ataxin-7-like protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn7l3bQ3UD01 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atxn7l3bQ3UD01 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atxn7l3bQ3UD01 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atxn7l3bQ3UD01 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atxn7l3bQ3UD01 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atxn7l3bQ3UD01 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atxn7l3bQ3UD01 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atxn7l3bQ3UD01 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atxn7l3bQ3UD01 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atxn7l3bQ3UD01 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atxn7l3bQ3UD01 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atxn7l3bQ3UD01 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atxn7l3bQ3UD01 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atxn7l3bQ3UD01 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atxn7l3bQ3UD01 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atxn7l3bQ3UD01 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atxn7l3bQ3UD01 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Atxn7l3bQ3UD01 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atxn7l3bQ3UD01 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atxn7l3bQ3UD01 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atxn7l3bQ3UD01 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atxn7l3bQ3UD01 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atxn7l3bQ3UD01 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atxn7l3bQ3UD01 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atxn7l3bQ3UD01 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atxn7l3bQ3UD01 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atxn7l3bQ3UD01 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atxn7l3bQ3UD01 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atxn7l3bQ3UD01 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atxn7l3bQ3UD01 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atxn7l3bQ3UD01 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atxn7l3bQ3UD01 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Atxn7l3bQ3UD01 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atxn7l3bQ3UD01 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atxn7l3bQ3UD01 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atxn7l3bQ3UD01 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atxn7l3bQ3UD01 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atxn7l3bQ3UD01 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atxn7l3bQ3UD01 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atxn7l3bQ3UD01 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atxn7l3bQ3UD01 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atxn7l3bQ3UD01 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atxn7l3bQ3UD01 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atxn7l3bQ3UD01 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Atxn7l3bQ3UD01 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Atxn7l3bQ3UD01 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Atxn7l3bQ3UD01 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atxn7l3bQ3UD01 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atxn7l3bQ3UD01 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atxn7l3bQ3UD01 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atxn7l3bQ3UD01 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atxn7l3bQ3UD01 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atxn7l3bQ3UD01 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atxn7l3bQ3UD01 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Atxn7l3bQ3UD01 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atxn7l3bQ3UD01 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atxn7l3bQ3UD01 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atxn7l3bQ3UD01 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atxn7l3bQ3UD01 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atxn7l3bQ3UD01 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atxn7l3bQ3UD01 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atxn7l3bQ3UD01 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atxn7l3bQ3UD01 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Atxn7l3bQ3UD01 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atxn7l3bQ3UD01 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atxn7l3bQ3UD01 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atxn7l3bQ3UD01 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atxn7l3bQ3UD01 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atxn7l3bQ3UD01 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atxn7l3bQ3UD01 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atxn7l3bQ3UD01 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atxn7l3bQ3UD01 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atxn7l3bQ3UD01 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Atxn7l3bQ3UD01 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Atxn7l3bQ3UD01 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Atxn7l3bQ3UD01 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atxn7l3bQ3UD01 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atxn7l3bQ3UD01 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atxn7l3bQ3UD01 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atxn7l3bQ3UD01 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atxn7l3bQ3UD01 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atxn7l3bQ3UD01 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atxn7l3bQ3UD01 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atxn7l3bQ3UD01 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atxn7l3bQ3UD01 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atxn7l3bQ3UD01 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atxn7l3bQ3UD01 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atxn7l3bQ3UD01 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atxn7l3bQ3UD01 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atxn7l3bQ3UD01 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atxn7l3bQ3UD01 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atxn7l3bQ3UD01 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atxn7l3bQ3UD01 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atxn7l3bQ3UD01 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atxn7l3bQ3UD01 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atxn7l3bQ3UD01 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atxn7l3bQ3UD01 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atxn7l3bQ3UD01 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atxn7l3bQ3UD01 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atxn7l3bQ3UD01 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms