Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gtpbp6Q3U6U5 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gtpbp6Q3U6U5 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gtpbp6Q3U6U5 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Tbata-210ENSMUST00000151886 915 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Gm25116-201ENSMUST00000157191 122 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Vmn1r185-201ENSMUST00000171039 1144 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Gm36991-201ENSMUST00000191800 648 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Gm11077-201ENSMUST00000111844 84 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Gm37073-201ENSMUST00000192469 1222 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gtpbp6Q3U6U5 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gtpbp6Q3U6U5 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gtpbp6Q3U6U5 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Gm42565-201ENSMUST00000197839 572 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gtpbp6Q3U6U5 AC129597.1-201ENSMUST00000223046 1234 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gtpbp6Q3U6U5 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43222-201ENSMUST00000199013 603 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Gm45574-201ENSMUST00000210921 331 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Gtpbp6Q3U6U5 2700097O09Rik-201ENSMUST00000021406 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gtpbp6Q3U6U5 AC139323.1-201ENSMUST00000223370 1040 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gtpbp6Q3U6U5 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gtpbp6Q3U6U5 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms