Protein–RNA interactions for Protein: Q3U319

Rnf40, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1B, mousemouse

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Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rnf40Q3U319 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
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Rnf40Q3U319 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Rnf40Q3U319 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Rnf40Q3U319 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Rnf40Q3U319 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rnf40Q3U319 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rnf40Q3U319 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Rnf40Q3U319 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Rnf40Q3U319 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rnf40Q3U319 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rnf40Q3U319 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Rnf40Q3U319 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rnf40Q3U319 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rnf40Q3U319 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Rnf40Q3U319 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rnf40Q3U319 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rnf40Q3U319 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rnf40Q3U319 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Rnf40Q3U319 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rnf40Q3U319 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Rnf40Q3U319 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Rnf40Q3U319 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rnf40Q3U319 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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