Protein–RNA interactions for Protein: Q3U285

Lcorl, Ligand-dependent nuclear receptor corepressor-like protein, mousemouse

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Length 600 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LcorlQ3U285 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LcorlQ3U285 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LcorlQ3U285 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LcorlQ3U285 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LcorlQ3U285 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LcorlQ3U285 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LcorlQ3U285 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
LcorlQ3U285 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LcorlQ3U285 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LcorlQ3U285 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LcorlQ3U285 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LcorlQ3U285 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LcorlQ3U285 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
LcorlQ3U285 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LcorlQ3U285 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LcorlQ3U285 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LcorlQ3U285 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LcorlQ3U285 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LcorlQ3U285 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LcorlQ3U285 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LcorlQ3U285 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LcorlQ3U285 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LcorlQ3U285 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LcorlQ3U285 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LcorlQ3U285 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LcorlQ3U285 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LcorlQ3U285 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LcorlQ3U285 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LcorlQ3U285 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LcorlQ3U285 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LcorlQ3U285 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LcorlQ3U285 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LcorlQ3U285 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LcorlQ3U285 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LcorlQ3U285 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LcorlQ3U285 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LcorlQ3U285 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LcorlQ3U285 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LcorlQ3U285 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LcorlQ3U285 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LcorlQ3U285 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LcorlQ3U285 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LcorlQ3U285 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LcorlQ3U285 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LcorlQ3U285 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LcorlQ3U285 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LcorlQ3U285 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LcorlQ3U285 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LcorlQ3U285 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LcorlQ3U285 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LcorlQ3U285 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LcorlQ3U285 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LcorlQ3U285 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LcorlQ3U285 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LcorlQ3U285 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LcorlQ3U285 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LcorlQ3U285 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LcorlQ3U285 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LcorlQ3U285 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LcorlQ3U285 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LcorlQ3U285 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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LcorlQ3U285 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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LcorlQ3U285 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LcorlQ3U285 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LcorlQ3U285 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LcorlQ3U285 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LcorlQ3U285 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LcorlQ3U285 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LcorlQ3U285 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LcorlQ3U285 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LcorlQ3U285 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LcorlQ3U285 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LcorlQ3U285 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LcorlQ3U285 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LcorlQ3U285 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LcorlQ3U285 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LcorlQ3U285 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LcorlQ3U285 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LcorlQ3U285 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LcorlQ3U285 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LcorlQ3U285 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LcorlQ3U285 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LcorlQ3U285 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LcorlQ3U285 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LcorlQ3U285 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LcorlQ3U285 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LcorlQ3U285 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LcorlQ3U285 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LcorlQ3U285 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms