Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0Y2

Tmem35b, Transmembrane protein 35B, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem35bQ3U0Y2 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmem35bQ3U0Y2 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmem35bQ3U0Y2 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmem35bQ3U0Y2 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmem35bQ3U0Y2 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmem35bQ3U0Y2 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmem35bQ3U0Y2 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmem35bQ3U0Y2 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmem35bQ3U0Y2 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmem35bQ3U0Y2 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmem35bQ3U0Y2 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmem35bQ3U0Y2 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmem35bQ3U0Y2 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmem35bQ3U0Y2 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmem35bQ3U0Y2 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmem35bQ3U0Y2 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmem35bQ3U0Y2 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmem35bQ3U0Y2 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmem35bQ3U0Y2 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmem35bQ3U0Y2 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem35bQ3U0Y2 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem35bQ3U0Y2 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem35bQ3U0Y2 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem35bQ3U0Y2 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem35bQ3U0Y2 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem35bQ3U0Y2 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem35bQ3U0Y2 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem35bQ3U0Y2 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem35bQ3U0Y2 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem35bQ3U0Y2 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem35bQ3U0Y2 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem35bQ3U0Y2 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem35bQ3U0Y2 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem35bQ3U0Y2 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem35bQ3U0Y2 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem35bQ3U0Y2 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem35bQ3U0Y2 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem35bQ3U0Y2 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem35bQ3U0Y2 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem35bQ3U0Y2 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem35bQ3U0Y2 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem35bQ3U0Y2 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem35bQ3U0Y2 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem35bQ3U0Y2 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem35bQ3U0Y2 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem35bQ3U0Y2 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem35bQ3U0Y2 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem35bQ3U0Y2 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem35bQ3U0Y2 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem35bQ3U0Y2 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem35bQ3U0Y2 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem35bQ3U0Y2 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem35bQ3U0Y2 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem35bQ3U0Y2 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem35bQ3U0Y2 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem35bQ3U0Y2 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem35bQ3U0Y2 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem35bQ3U0Y2 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem35bQ3U0Y2 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem35bQ3U0Y2 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem35bQ3U0Y2 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem35bQ3U0Y2 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem35bQ3U0Y2 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem35bQ3U0Y2 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem35bQ3U0Y2 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem35bQ3U0Y2 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmem35bQ3U0Y2 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmem35bQ3U0Y2 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmem35bQ3U0Y2 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmem35bQ3U0Y2 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmem35bQ3U0Y2 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmem35bQ3U0Y2 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmem35bQ3U0Y2 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmem35bQ3U0Y2 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmem35bQ3U0Y2 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmem35bQ3U0Y2 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmem35bQ3U0Y2 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmem35bQ3U0Y2 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmem35bQ3U0Y2 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmem35bQ3U0Y2 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmem35bQ3U0Y2 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmem35bQ3U0Y2 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmem35bQ3U0Y2 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmem35bQ3U0Y2 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmem35bQ3U0Y2 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmem35bQ3U0Y2 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmem35bQ3U0Y2 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmem35bQ3U0Y2 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmem35bQ3U0Y2 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmem35bQ3U0Y2 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmem35bQ3U0Y2 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmem35bQ3U0Y2 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmem35bQ3U0Y2 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tmem35bQ3U0Y2 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tmem35bQ3U0Y2 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tmem35bQ3U0Y2 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tmem35bQ3U0Y2 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tmem35bQ3U0Y2 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tmem35bQ3U0Y2 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmem35bQ3U0Y2 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms