Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0P1

Palb2, Partner and localizer of BRCA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palb2Q3U0P1 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Palb2Q3U0P1 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Palb2Q3U0P1 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Palb2Q3U0P1 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Palb2Q3U0P1 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Palb2Q3U0P1 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Palb2Q3U0P1 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Palb2Q3U0P1 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Palb2Q3U0P1 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Palb2Q3U0P1 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Palb2Q3U0P1 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Palb2Q3U0P1 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Palb2Q3U0P1 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Palb2Q3U0P1 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Palb2Q3U0P1 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Palb2Q3U0P1 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Palb2Q3U0P1 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Palb2Q3U0P1 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Palb2Q3U0P1 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Palb2Q3U0P1 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Palb2Q3U0P1 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Palb2Q3U0P1 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Palb2Q3U0P1 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Palb2Q3U0P1 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Palb2Q3U0P1 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Palb2Q3U0P1 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Palb2Q3U0P1 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Palb2Q3U0P1 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Palb2Q3U0P1 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Palb2Q3U0P1 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Palb2Q3U0P1 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Palb2Q3U0P1 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Palb2Q3U0P1 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Palb2Q3U0P1 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Palb2Q3U0P1 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Palb2Q3U0P1 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Palb2Q3U0P1 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Palb2Q3U0P1 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Palb2Q3U0P1 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Palb2Q3U0P1 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Palb2Q3U0P1 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Palb2Q3U0P1 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Palb2Q3U0P1 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Palb2Q3U0P1 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Palb2Q3U0P1 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Palb2Q3U0P1 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Palb2Q3U0P1 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Palb2Q3U0P1 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Palb2Q3U0P1 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Palb2Q3U0P1 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Palb2Q3U0P1 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Palb2Q3U0P1 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Palb2Q3U0P1 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Palb2Q3U0P1 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Palb2Q3U0P1 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Palb2Q3U0P1 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Palb2Q3U0P1 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Palb2Q3U0P1 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Palb2Q3U0P1 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Palb2Q3U0P1 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Palb2Q3U0P1 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Palb2Q3U0P1 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Palb2Q3U0P1 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Palb2Q3U0P1 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Palb2Q3U0P1 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Palb2Q3U0P1 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Palb2Q3U0P1 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Palb2Q3U0P1 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Palb2Q3U0P1 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Palb2Q3U0P1 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Palb2Q3U0P1 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Palb2Q3U0P1 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Palb2Q3U0P1 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Palb2Q3U0P1 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Palb2Q3U0P1 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Palb2Q3U0P1 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Palb2Q3U0P1 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Palb2Q3U0P1 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Palb2Q3U0P1 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Palb2Q3U0P1 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Palb2Q3U0P1 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Palb2Q3U0P1 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Palb2Q3U0P1 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Palb2Q3U0P1 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Palb2Q3U0P1 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Palb2Q3U0P1 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Palb2Q3U0P1 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Palb2Q3U0P1 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Palb2Q3U0P1 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Palb2Q3U0P1 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Palb2Q3U0P1 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Palb2Q3U0P1 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Palb2Q3U0P1 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Palb2Q3U0P1 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Palb2Q3U0P1 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Palb2Q3U0P1 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Palb2Q3U0P1 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Palb2Q3U0P1 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Palb2Q3U0P1 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Palb2Q3U0P1 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms