Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc9Q3U0M1 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc9Q3U0M1 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc9Q3U0M1 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc9Q3U0M1 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc9Q3U0M1 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc9Q3U0M1 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc9Q3U0M1 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc9Q3U0M1 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc9Q3U0M1 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc9Q3U0M1 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc9Q3U0M1 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc9Q3U0M1 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc9Q3U0M1 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc9Q3U0M1 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc9Q3U0M1 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc9Q3U0M1 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc9Q3U0M1 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc9Q3U0M1 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc9Q3U0M1 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc9Q3U0M1 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc9Q3U0M1 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc9Q3U0M1 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc9Q3U0M1 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc9Q3U0M1 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc9Q3U0M1 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc9Q3U0M1 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc9Q3U0M1 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc9Q3U0M1 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc9Q3U0M1 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc9Q3U0M1 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc9Q3U0M1 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc9Q3U0M1 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc9Q3U0M1 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc9Q3U0M1 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc9Q3U0M1 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc9Q3U0M1 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc9Q3U0M1 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc9Q3U0M1 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc9Q3U0M1 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc9Q3U0M1 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc9Q3U0M1 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc9Q3U0M1 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc9Q3U0M1 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc9Q3U0M1 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc9Q3U0M1 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc9Q3U0M1 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc9Q3U0M1 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc9Q3U0M1 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc9Q3U0M1 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc9Q3U0M1 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc9Q3U0M1 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc9Q3U0M1 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc9Q3U0M1 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc9Q3U0M1 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc9Q3U0M1 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc9Q3U0M1 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc9Q3U0M1 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc9Q3U0M1 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc9Q3U0M1 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc9Q3U0M1 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc9Q3U0M1 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc9Q3U0M1 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc9Q3U0M1 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc9Q3U0M1 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc9Q3U0M1 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc9Q3U0M1 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc9Q3U0M1 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc9Q3U0M1 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc9Q3U0M1 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc9Q3U0M1 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc9Q3U0M1 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc9Q3U0M1 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc9Q3U0M1 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc9Q3U0M1 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc9Q3U0M1 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc9Q3U0M1 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc9Q3U0M1 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc9Q3U0M1 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc9Q3U0M1 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc9Q3U0M1 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc9Q3U0M1 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc9Q3U0M1 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc9Q3U0M1 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc9Q3U0M1 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc9Q3U0M1 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc9Q3U0M1 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc9Q3U0M1 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc9Q3U0M1 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc9Q3U0M1 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc9Q3U0M1 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc9Q3U0M1 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc9Q3U0M1 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc9Q3U0M1 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc9Q3U0M1 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc9Q3U0M1 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc9Q3U0M1 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc9Q3U0M1 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc9Q3U0M1 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc9Q3U0M1 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms