Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVA9

Ccdc136, Coiled-coil domain-containing protein 136, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc136Q3TVA9 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ccdc136Q3TVA9 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ccdc136Q3TVA9 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ccdc136Q3TVA9 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ccdc136Q3TVA9 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ccdc136Q3TVA9 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ccdc136Q3TVA9 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ccdc136Q3TVA9 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ccdc136Q3TVA9 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ccdc136Q3TVA9 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ccdc136Q3TVA9 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ccdc136Q3TVA9 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ccdc136Q3TVA9 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ccdc136Q3TVA9 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ccdc136Q3TVA9 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Ccdc136Q3TVA9 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ccdc136Q3TVA9 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ccdc136Q3TVA9 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ccdc136Q3TVA9 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ccdc136Q3TVA9 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ccdc136Q3TVA9 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ccdc136Q3TVA9 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ccdc136Q3TVA9 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ccdc136Q3TVA9 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ccdc136Q3TVA9 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ccdc136Q3TVA9 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ccdc136Q3TVA9 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Ccdc136Q3TVA9 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ccdc136Q3TVA9 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ccdc136Q3TVA9 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ccdc136Q3TVA9 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ccdc136Q3TVA9 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ccdc136Q3TVA9 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ccdc136Q3TVA9 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ccdc136Q3TVA9 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ccdc136Q3TVA9 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ccdc136Q3TVA9 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ccdc136Q3TVA9 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ccdc136Q3TVA9 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ccdc136Q3TVA9 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Ccdc136Q3TVA9 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ccdc136Q3TVA9 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ccdc136Q3TVA9 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ccdc136Q3TVA9 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Ccdc136Q3TVA9 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ccdc136Q3TVA9 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ccdc136Q3TVA9 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ccdc136Q3TVA9 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ccdc136Q3TVA9 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ccdc136Q3TVA9 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ccdc136Q3TVA9 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ccdc136Q3TVA9 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ccdc136Q3TVA9 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Ccdc136Q3TVA9 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ccdc136Q3TVA9 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ccdc136Q3TVA9 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ccdc136Q3TVA9 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ccdc136Q3TVA9 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ccdc136Q3TVA9 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ccdc136Q3TVA9 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ccdc136Q3TVA9 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ccdc136Q3TVA9 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ccdc136Q3TVA9 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ccdc136Q3TVA9 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ccdc136Q3TVA9 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ccdc136Q3TVA9 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Ccdc136Q3TVA9 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Ccdc136Q3TVA9 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Ccdc136Q3TVA9 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Ccdc136Q3TVA9 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Ccdc136Q3TVA9 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ccdc136Q3TVA9 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ccdc136Q3TVA9 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ccdc136Q3TVA9 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ccdc136Q3TVA9 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ccdc136Q3TVA9 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ccdc136Q3TVA9 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ccdc136Q3TVA9 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ccdc136Q3TVA9 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ccdc136Q3TVA9 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ccdc136Q3TVA9 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ccdc136Q3TVA9 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ccdc136Q3TVA9 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ccdc136Q3TVA9 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ccdc136Q3TVA9 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ccdc136Q3TVA9 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Ccdc136Q3TVA9 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Ccdc136Q3TVA9 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ccdc136Q3TVA9 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ccdc136Q3TVA9 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ccdc136Q3TVA9 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ccdc136Q3TVA9 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ccdc136Q3TVA9 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ccdc136Q3TVA9 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ccdc136Q3TVA9 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ccdc136Q3TVA9 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ccdc136Q3TVA9 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ccdc136Q3TVA9 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ccdc136Q3TVA9 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ccdc136Q3TVA9 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms