Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTP0

Shcbp1l, Testicular spindle-associated protein SHCBP1L, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1lQ3TTP0 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shcbp1lQ3TTP0 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shcbp1lQ3TTP0 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shcbp1lQ3TTP0 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shcbp1lQ3TTP0 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shcbp1lQ3TTP0 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Shcbp1lQ3TTP0 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Shcbp1lQ3TTP0 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Shcbp1lQ3TTP0 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Shcbp1lQ3TTP0 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Shcbp1lQ3TTP0 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Shcbp1lQ3TTP0 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Shcbp1lQ3TTP0 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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