Protein–RNA interactions for Protein: Q3TT99

Gdpd4, Glycerophosphodiester phosphodiesterase domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 632 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd4Q3TT99 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gdpd4Q3TT99 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gdpd4Q3TT99 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gdpd4Q3TT99 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gdpd4Q3TT99 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gdpd4Q3TT99 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gdpd4Q3TT99 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gdpd4Q3TT99 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gdpd4Q3TT99 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gdpd4Q3TT99 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gdpd4Q3TT99 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gdpd4Q3TT99 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gdpd4Q3TT99 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gdpd4Q3TT99 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gdpd4Q3TT99 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gdpd4Q3TT99 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Gdpd4Q3TT99 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Gdpd4Q3TT99 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gdpd4Q3TT99 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gdpd4Q3TT99 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gdpd4Q3TT99 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gdpd4Q3TT99 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gdpd4Q3TT99 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gdpd4Q3TT99 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Gdpd4Q3TT99 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gdpd4Q3TT99 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gdpd4Q3TT99 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gdpd4Q3TT99 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gdpd4Q3TT99 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gdpd4Q3TT99 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gdpd4Q3TT99 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gdpd4Q3TT99 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gdpd4Q3TT99 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gdpd4Q3TT99 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gdpd4Q3TT99 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gdpd4Q3TT99 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gdpd4Q3TT99 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gdpd4Q3TT99 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gdpd4Q3TT99 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gdpd4Q3TT99 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gdpd4Q3TT99 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gdpd4Q3TT99 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gdpd4Q3TT99 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Gdpd4Q3TT99 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gdpd4Q3TT99 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gdpd4Q3TT99 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gdpd4Q3TT99 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gdpd4Q3TT99 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gdpd4Q3TT99 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gdpd4Q3TT99 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gdpd4Q3TT99 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gdpd4Q3TT99 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gdpd4Q3TT99 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gdpd4Q3TT99 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gdpd4Q3TT99 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gdpd4Q3TT99 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gdpd4Q3TT99 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gdpd4Q3TT99 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gdpd4Q3TT99 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gdpd4Q3TT99 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gdpd4Q3TT99 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gdpd4Q3TT99 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Gdpd4Q3TT99 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gdpd4Q3TT99 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Gdpd4Q3TT99 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gdpd4Q3TT99 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gdpd4Q3TT99 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gdpd4Q3TT99 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gdpd4Q3TT99 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gdpd4Q3TT99 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gdpd4Q3TT99 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gdpd4Q3TT99 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gdpd4Q3TT99 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gdpd4Q3TT99 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gdpd4Q3TT99 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gdpd4Q3TT99 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Gdpd4Q3TT99 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Gdpd4Q3TT99 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Gdpd4Q3TT99 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Gdpd4Q3TT99 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Gdpd4Q3TT99 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Gdpd4Q3TT99 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Gdpd4Q3TT99 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gdpd4Q3TT99 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gdpd4Q3TT99 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Gdpd4Q3TT99 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Gdpd4Q3TT99 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gdpd4Q3TT99 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gdpd4Q3TT99 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gdpd4Q3TT99 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gdpd4Q3TT99 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gdpd4Q3TT99 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gdpd4Q3TT99 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gdpd4Q3TT99 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gdpd4Q3TT99 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gdpd4Q3TT99 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gdpd4Q3TT99 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gdpd4Q3TT99 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gdpd4Q3TT99 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gdpd4Q3TT99 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms