Protein–RNA interactions for Protein: Q3TSA9

Fbxw18, Expressed sequence C85627, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxw18Q3TSA9 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fbxw18Q3TSA9 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fbxw18Q3TSA9 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fbxw18Q3TSA9 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fbxw18Q3TSA9 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fbxw18Q3TSA9 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fbxw18Q3TSA9 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fbxw18Q3TSA9 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fbxw18Q3TSA9 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fbxw18Q3TSA9 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fbxw18Q3TSA9 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fbxw18Q3TSA9 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fbxw18Q3TSA9 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fbxw18Q3TSA9 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Fbxw18Q3TSA9 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Fbxw18Q3TSA9 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Fbxw18Q3TSA9 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fbxw18Q3TSA9 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fbxw18Q3TSA9 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fbxw18Q3TSA9 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fbxw18Q3TSA9 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fbxw18Q3TSA9 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fbxw18Q3TSA9 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fbxw18Q3TSA9 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fbxw18Q3TSA9 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fbxw18Q3TSA9 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fbxw18Q3TSA9 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fbxw18Q3TSA9 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fbxw18Q3TSA9 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fbxw18Q3TSA9 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fbxw18Q3TSA9 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fbxw18Q3TSA9 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fbxw18Q3TSA9 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Fbxw18Q3TSA9 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fbxw18Q3TSA9 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fbxw18Q3TSA9 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fbxw18Q3TSA9 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fbxw18Q3TSA9 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Fbxw18Q3TSA9 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fbxw18Q3TSA9 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fbxw18Q3TSA9 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fbxw18Q3TSA9 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fbxw18Q3TSA9 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fbxw18Q3TSA9 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fbxw18Q3TSA9 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fbxw18Q3TSA9 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fbxw18Q3TSA9 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fbxw18Q3TSA9 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fbxw18Q3TSA9 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fbxw18Q3TSA9 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fbxw18Q3TSA9 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fbxw18Q3TSA9 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fbxw18Q3TSA9 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fbxw18Q3TSA9 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fbxw18Q3TSA9 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fbxw18Q3TSA9 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fbxw18Q3TSA9 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fbxw18Q3TSA9 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fbxw18Q3TSA9 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fbxw18Q3TSA9 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fbxw18Q3TSA9 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fbxw18Q3TSA9 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fbxw18Q3TSA9 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fbxw18Q3TSA9 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fbxw18Q3TSA9 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fbxw18Q3TSA9 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Fbxw18Q3TSA9 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fbxw18Q3TSA9 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fbxw18Q3TSA9 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fbxw18Q3TSA9 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fbxw18Q3TSA9 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fbxw18Q3TSA9 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fbxw18Q3TSA9 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fbxw18Q3TSA9 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fbxw18Q3TSA9 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fbxw18Q3TSA9 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fbxw18Q3TSA9 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fbxw18Q3TSA9 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fbxw18Q3TSA9 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fbxw18Q3TSA9 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fbxw18Q3TSA9 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fbxw18Q3TSA9 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fbxw18Q3TSA9 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fbxw18Q3TSA9 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fbxw18Q3TSA9 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Fbxw18Q3TSA9 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fbxw18Q3TSA9 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fbxw18Q3TSA9 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fbxw18Q3TSA9 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fbxw18Q3TSA9 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fbxw18Q3TSA9 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fbxw18Q3TSA9 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fbxw18Q3TSA9 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fbxw18Q3TSA9 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fbxw18Q3TSA9 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fbxw18Q3TSA9 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fbxw18Q3TSA9 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fbxw18Q3TSA9 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fbxw18Q3TSA9 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fbxw18Q3TSA9 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms