Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKT4

Smarca4, Transcription activator BRG1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca4Q3TKT4 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Smarca4Q3TKT4 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Smarca4Q3TKT4 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
Smarca4Q3TKT4 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Smarca4Q3TKT4 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
Smarca4Q3TKT4 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
Smarca4Q3TKT4 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Smarca4Q3TKT4 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Smarca4Q3TKT4 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
Smarca4Q3TKT4 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Smarca4Q3TKT4 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Smarca4Q3TKT4 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Smarca4Q3TKT4 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Smarca4Q3TKT4 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Smarca4Q3TKT4 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Smarca4Q3TKT4 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Smarca4Q3TKT4 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Smarca4Q3TKT4 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Smarca4Q3TKT4 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Smarca4Q3TKT4 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Smarca4Q3TKT4 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Smarca4Q3TKT4 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Smarca4Q3TKT4 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Smarca4Q3TKT4 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Smarca4Q3TKT4 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Smarca4Q3TKT4 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Smarca4Q3TKT4 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Smarca4Q3TKT4 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Smarca4Q3TKT4 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Smarca4Q3TKT4 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Smarca4Q3TKT4 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Smarca4Q3TKT4 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Smarca4Q3TKT4 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Smarca4Q3TKT4 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Smarca4Q3TKT4 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Smarca4Q3TKT4 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Smarca4Q3TKT4 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Smarca4Q3TKT4 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Smarca4Q3TKT4 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Smarca4Q3TKT4 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Smarca4Q3TKT4 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Smarca4Q3TKT4 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Smarca4Q3TKT4 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Smarca4Q3TKT4 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Smarca4Q3TKT4 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Smarca4Q3TKT4 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Smarca4Q3TKT4 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Smarca4Q3TKT4 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Smarca4Q3TKT4 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Smarca4Q3TKT4 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Smarca4Q3TKT4 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Smarca4Q3TKT4 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Smarca4Q3TKT4 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Smarca4Q3TKT4 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Smarca4Q3TKT4 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Smarca4Q3TKT4 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Smarca4Q3TKT4 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Smarca4Q3TKT4 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Smarca4Q3TKT4 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Smarca4Q3TKT4 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Smarca4Q3TKT4 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Smarca4Q3TKT4 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Smarca4Q3TKT4 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Smarca4Q3TKT4 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Smarca4Q3TKT4 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Smarca4Q3TKT4 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Smarca4Q3TKT4 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Smarca4Q3TKT4 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Smarca4Q3TKT4 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Smarca4Q3TKT4 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Smarca4Q3TKT4 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Smarca4Q3TKT4 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Smarca4Q3TKT4 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Smarca4Q3TKT4 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Smarca4Q3TKT4 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Smarca4Q3TKT4 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Smarca4Q3TKT4 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Smarca4Q3TKT4 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Smarca4Q3TKT4 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Smarca4Q3TKT4 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Smarca4Q3TKT4 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Smarca4Q3TKT4 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Smarca4Q3TKT4 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Smarca4Q3TKT4 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Smarca4Q3TKT4 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Smarca4Q3TKT4 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Smarca4Q3TKT4 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Smarca4Q3TKT4 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Smarca4Q3TKT4 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Smarca4Q3TKT4 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Smarca4Q3TKT4 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Smarca4Q3TKT4 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Smarca4Q3TKT4 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Smarca4Q3TKT4 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Smarca4Q3TKT4 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Smarca4Q3TKT4 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
Smarca4Q3TKT4 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Smarca4Q3TKT4 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Smarca4Q3TKT4 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Smarca4Q3TKT4 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms