Protein–RNA interactions for Protein: Q3TGW2

Eepd1, Endonuclease/exonuclease/phosphatase family domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eepd1Q3TGW2 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Eepd1Q3TGW2 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Eepd1Q3TGW2 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Eepd1Q3TGW2 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Eepd1Q3TGW2 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Eepd1Q3TGW2 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Eepd1Q3TGW2 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Eepd1Q3TGW2 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Eepd1Q3TGW2 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Eepd1Q3TGW2 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Eepd1Q3TGW2 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Eepd1Q3TGW2 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Eepd1Q3TGW2 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Eepd1Q3TGW2 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Eepd1Q3TGW2 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Eepd1Q3TGW2 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Eepd1Q3TGW2 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Eepd1Q3TGW2 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Eepd1Q3TGW2 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Eepd1Q3TGW2 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Eepd1Q3TGW2 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Eepd1Q3TGW2 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Eepd1Q3TGW2 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Eepd1Q3TGW2 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Eepd1Q3TGW2 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Eepd1Q3TGW2 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Eepd1Q3TGW2 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Eepd1Q3TGW2 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Eepd1Q3TGW2 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Eepd1Q3TGW2 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Eepd1Q3TGW2 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Eepd1Q3TGW2 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Eepd1Q3TGW2 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Eepd1Q3TGW2 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Eepd1Q3TGW2 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Eepd1Q3TGW2 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Eepd1Q3TGW2 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Eepd1Q3TGW2 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Eepd1Q3TGW2 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Eepd1Q3TGW2 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Eepd1Q3TGW2 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Eepd1Q3TGW2 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Eepd1Q3TGW2 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Eepd1Q3TGW2 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Eepd1Q3TGW2 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Eepd1Q3TGW2 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Eepd1Q3TGW2 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Eepd1Q3TGW2 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Eepd1Q3TGW2 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Eepd1Q3TGW2 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Eepd1Q3TGW2 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Eepd1Q3TGW2 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Eepd1Q3TGW2 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Eepd1Q3TGW2 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Eepd1Q3TGW2 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Eepd1Q3TGW2 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Eepd1Q3TGW2 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Eepd1Q3TGW2 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Eepd1Q3TGW2 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Eepd1Q3TGW2 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Eepd1Q3TGW2 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Eepd1Q3TGW2 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Eepd1Q3TGW2 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Eepd1Q3TGW2 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Eepd1Q3TGW2 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Eepd1Q3TGW2 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Eepd1Q3TGW2 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Eepd1Q3TGW2 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Eepd1Q3TGW2 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Eepd1Q3TGW2 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Eepd1Q3TGW2 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Eepd1Q3TGW2 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Eepd1Q3TGW2 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Eepd1Q3TGW2 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Eepd1Q3TGW2 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Eepd1Q3TGW2 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Eepd1Q3TGW2 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Eepd1Q3TGW2 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Eepd1Q3TGW2 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Eepd1Q3TGW2 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Eepd1Q3TGW2 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Eepd1Q3TGW2 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Eepd1Q3TGW2 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Eepd1Q3TGW2 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Eepd1Q3TGW2 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Eepd1Q3TGW2 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Eepd1Q3TGW2 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Eepd1Q3TGW2 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Eepd1Q3TGW2 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Eepd1Q3TGW2 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Eepd1Q3TGW2 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Eepd1Q3TGW2 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Eepd1Q3TGW2 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Eepd1Q3TGW2 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Eepd1Q3TGW2 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Eepd1Q3TGW2 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Eepd1Q3TGW2 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Eepd1Q3TGW2 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Eepd1Q3TGW2 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Eepd1Q3TGW2 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms