Protein–RNA interactions for Protein: Q3TDV8

Zfp444, Zinc finger protein 444, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp444Q3TDV8 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Zfp444Q3TDV8 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Zfp444Q3TDV8 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Zfp444Q3TDV8 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Zfp444Q3TDV8 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Zfp444Q3TDV8 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Zfp444Q3TDV8 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Zfp444Q3TDV8 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Zfp444Q3TDV8 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Zfp444Q3TDV8 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Zfp444Q3TDV8 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Zfp444Q3TDV8 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Zfp444Q3TDV8 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Zfp444Q3TDV8 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Zfp444Q3TDV8 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Zfp444Q3TDV8 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Zfp444Q3TDV8 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Zfp444Q3TDV8 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Zfp444Q3TDV8 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Zfp444Q3TDV8 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Zfp444Q3TDV8 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Zfp444Q3TDV8 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Zfp444Q3TDV8 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Zfp444Q3TDV8 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Zfp444Q3TDV8 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Zfp444Q3TDV8 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Zfp444Q3TDV8 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Zfp444Q3TDV8 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Zfp444Q3TDV8 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Zfp444Q3TDV8 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Zfp444Q3TDV8 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Zfp444Q3TDV8 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Zfp444Q3TDV8 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Zfp444Q3TDV8 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Zfp444Q3TDV8 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Zfp444Q3TDV8 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Zfp444Q3TDV8 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Zfp444Q3TDV8 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Zfp444Q3TDV8 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Zfp444Q3TDV8 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Zfp444Q3TDV8 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Zfp444Q3TDV8 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Zfp444Q3TDV8 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Zfp444Q3TDV8 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Zfp444Q3TDV8 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Zfp444Q3TDV8 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Zfp444Q3TDV8 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Zfp444Q3TDV8 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Zfp444Q3TDV8 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Zfp444Q3TDV8 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Zfp444Q3TDV8 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Zfp444Q3TDV8 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Zfp444Q3TDV8 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Zfp444Q3TDV8 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Zfp444Q3TDV8 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Zfp444Q3TDV8 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Zfp444Q3TDV8 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Zfp444Q3TDV8 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Zfp444Q3TDV8 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Zfp444Q3TDV8 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Zfp444Q3TDV8 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Zfp444Q3TDV8 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Zfp444Q3TDV8 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Zfp444Q3TDV8 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Zfp444Q3TDV8 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Zfp444Q3TDV8 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Zfp444Q3TDV8 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Zfp444Q3TDV8 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Zfp444Q3TDV8 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Zfp444Q3TDV8 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Zfp444Q3TDV8 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Zfp444Q3TDV8 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Zfp444Q3TDV8 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Zfp444Q3TDV8 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Zfp444Q3TDV8 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Zfp444Q3TDV8 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Zfp444Q3TDV8 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Zfp444Q3TDV8 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Zfp444Q3TDV8 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Zfp444Q3TDV8 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Zfp444Q3TDV8 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Zfp444Q3TDV8 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Zfp444Q3TDV8 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Zfp444Q3TDV8 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Zfp444Q3TDV8 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Zfp444Q3TDV8 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Zfp444Q3TDV8 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Zfp444Q3TDV8 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Zfp444Q3TDV8 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Zfp444Q3TDV8 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Zfp444Q3TDV8 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Zfp444Q3TDV8 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Zfp444Q3TDV8 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Zfp444Q3TDV8 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Zfp444Q3TDV8 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Zfp444Q3TDV8 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Zfp444Q3TDV8 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Zfp444Q3TDV8 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Zfp444Q3TDV8 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Zfp444Q3TDV8 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms